116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1125 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 880 aa  1748    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  32.63 
 
 		 651 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  28.14 
 
 		 794 aa  220  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  29.13 
 
 		 794 aa  220  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.93 
 
 		 792 aa  168  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.7 
 
 		 738 aa  156  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 		 731 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.38 
 
 		 821 aa  142  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  26.45 
 
 		 800 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  26.28 
 
 		 800 aa  140  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  24.46 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  30.77 
 
 		 834 aa  137  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  29.74 
 
 		 765 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  23.17 
 
 		 801 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  24.76 
 
 		 667 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.32 
 
 		 820 aa  125  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.89 
 
 		 724 aa  125  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  22.44 
 
 		 740 aa  125  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  22.87 
 
 		 732 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  28.36 
 
 		 778 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 		 783 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  22.85 
 
 		 745 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  24.06 
 
 		 904 aa  121  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  25.35 
 
 		 858 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.99 
 
 		 692 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 722 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.82 
 
 		 733 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  26.09 
 
 		 821 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  22.37 
 
 		 782 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 		 728 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.28 
 
 		 824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  21.97 
 
 		 745 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  21.49 
 
 		 792 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  26.54 
 
 		 739 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  22.86 
 
 		 1078 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  23.26 
 
 		 753 aa  115  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 829 aa  114  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  23.02 
 
 		 781 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  25.41 
 
 		 804 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  26.55 
 
 		 822 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  26.34 
 
 		 772 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  23.75 
 
 		 661 aa  112  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  21.07 
 
 		 1084 aa  112  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  20.63 
 
 		 722 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  24.4 
 
 		 777 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.92 
 
 		 724 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 		 732 aa  108  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.66 
 
 		 825 aa  107  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.78 
 
 		 717 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  20.74 
 
 		 751 aa  105  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  23.83 
 
 		 729 aa  104  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  24.45 
 
 		 784 aa  103  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  24.63 
 
 		 807 aa  102  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  22.38 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.23 
 
 		 744 aa  98.6  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  19.8 
 
 		 794 aa  96.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  22.42 
 
 		 805 aa  92  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.04 
 
 		 721 aa  84.7  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  19.33 
 
 		 759 aa  84.7  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  23.47 
 
 		 864 aa  84.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  23.61 
 
 		 729 aa  82.4  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  19.83 
 
 		 856 aa  81.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 730 aa  79.7  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  19.2 
 
 		 752 aa  79  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  23.34 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  20.83 
 
 		 779 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  20.26 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  22.07 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  23.8 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  21.65 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  24.61 
 
 		 804 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.31 
 
 		 744 aa  73.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  22.77 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  20.64 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.47 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  23.86 
 
 		 780 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  17.62 
 
 		 1027 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  22.26 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  19.36 
 
 		 854 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  19.83 
 
 		 801 aa  62  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.43 
 
 		 737 aa  62  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.26 
 
 		 492 aa  62  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  19.84 
 
 		 917 aa  59.7  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  29.05 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  20.11 
 
 		 566 aa  56.6  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  22.59 
 
 		 933 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  23.58 
 
 		 832 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  18.76 
 
 		 887 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.51 
 
 		 488 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  21.66 
 
 		 927 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  20.77 
 
 		 901 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  19.55 
 
 		 887 aa  52  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  21.1 
 
 		 795 aa  51.6  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  21.94 
 
 		 899 aa  51.2  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.05 
 
 		 885 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  22.13 
 
 		 491 aa  50.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  20.12 
 
 		 888 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  21.66 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  21.57 
 
 		 939 aa  49.7  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  20.24 
 
 		 888 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>