108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4562 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 914 aa  1890    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  24.09 
 
 		 843 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.26 
 
 		 799 aa  78.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  20.81 
 
 		 929 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  22.8 
 
 		 888 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.71 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  23.42 
 
 		 912 aa  66.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  21.76 
 
 		 1027 aa  66.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  20.2 
 
 		 801 aa  65.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  22.43 
 
 		 888 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  22.33 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  22.71 
 
 		 828 aa  65.1  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  25.07 
 
 		 783 aa  64.7  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  22.17 
 
 		 879 aa  62  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  21.48 
 
 		 905 aa  61.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  20.43 
 
 		 566 aa  60.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  22.12 
 
 		 873 aa  60.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  24.13 
 
 		 548 aa  60.1  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  21.43 
 
 		 883 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4391  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.09 
 
 		 842 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  22.88 
 
 		 762 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  20.45 
 
 		 811 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.17 
 
 		 737 aa  57  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  23.33 
 
 		 908 aa  55.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  21.59 
 
 		 917 aa  55.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  20.63 
 
 		 750 aa  55.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  31.75 
 
 		 780 aa  55.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  22.89 
 
 		 829 aa  54.7  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  19.59 
 
 		 726 aa  54.3  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  22.68 
 
 		 651 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  21.81 
 
 		 566 aa  54.3  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  25.12 
 
 		 904 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  23.54 
 
 		 915 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  21.26 
 
 		 800 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  22.2 
 
 		 795 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  20.07 
 
 		 899 aa  52.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  22.11 
 
 		 860 aa  52.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  22.1 
 
 		 912 aa  51.6  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  23.61 
 
 		 885 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  23.47 
 
 		 906 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  21.83 
 
 		 827 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  22.88 
 
 		 836 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  21.65 
 
 		 933 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.06 
 
 		 892 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  20.97 
 
 		 492 aa  50.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  24.26 
 
 		 822 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  20.8 
 
 		 708 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  21.88 
 
 		 921 aa  49.7  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  23.05 
 
 		 904 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  21.88 
 
 		 594 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  22.73 
 
 		 759 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  20.54 
 
 		 885 aa  49.3  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  23 
 
 		 899 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  21.81 
 
 		 804 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.36 
 
 		 724 aa  47.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.01 
 
 		 751 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  20.52 
 
 		 854 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  22.94 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.04 
 
 		 721 aa  47.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  20.13 
 
 		 897 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  26.87 
 
 		 753 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.06 
 
 		 736 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.74 
 
 		 967 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  21.19 
 
 		 899 aa  47  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  22.28 
 
 		 887 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  21.04 
 
 		 821 aa  47  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  25.58 
 
 		 611 aa  46.2  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.21 
 
 		 611 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  20.05 
 
 		 859 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.21 
 
 		 609 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.58 
 
 		 609 aa  46.2  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  29.36 
 
 		 730 aa  46.2  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.21 
 
 		 609 aa  46.2  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.21 
 
 		 609 aa  45.8  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  21.63 
 
 		 887 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.21 
 
 		 611 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.13 
 
 		 607 aa  46.2  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  27.21 
 
 		 609 aa  46.2  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  20.59 
 
 		 920 aa  45.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.75 
 
 		 610 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.64 
 
 		 815 aa  45.8  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.75 
 
 		 610 aa  45.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  21.62 
 
 		 856 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36 
 
 		 970 aa  45.8  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  21.46 
 
 		 907 aa  45.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  35.38 
 
 		 754 aa  45.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  36.92 
 
 		 634 aa  45.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  19.96 
 
 		 933 aa  45.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  26.45 
 
 		 850 aa  45.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  35.38 
 
 		 634 aa  45.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  35.38 
 
 		 634 aa  45.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  37.31 
 
 		 639 aa  45.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  20.83 
 
 		 948 aa  45.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  35.38 
 
 		 634 aa  45.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.46 
 
 		 597 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.58 
 
 		 611 aa  44.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28 
 
 		 615 aa  45.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  22.39 
 
 		 661 aa  45.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.22 
 
 		 608 aa  44.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>