More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4391 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4391  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
842 aa  1705    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2641  helicase-like protein  33.15 
 
 
831 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619117  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2945  putative DEAD/DEAH box helicase  27.69 
 
 
843 aa  229  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.79 
 
 
635 aa  147  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.92 
 
 
793 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.58 
 
 
679 aa  143  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.72 
 
 
602 aa  143  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.56 
 
 
606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.61 
 
 
598 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.16 
 
 
593 aa  141  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.16 
 
 
593 aa  141  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.07 
 
 
679 aa  141  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.55 
 
 
728 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.1 
 
 
488 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30 
 
 
451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.73 
 
 
624 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.32 
 
 
705 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.43 
 
 
535 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.26 
 
 
625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.59 
 
 
718 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.3 
 
 
790 aa  135  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  28.57 
 
 
503 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.75 
 
 
552 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.95 
 
 
592 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.88 
 
 
592 aa  134  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  30.54 
 
 
637 aa  134  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.05 
 
 
722 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.63 
 
 
685 aa  134  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.26 
 
 
731 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.82 
 
 
707 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.77 
 
 
681 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.29 
 
 
607 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.65 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.65 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.17 
 
 
632 aa  134  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.65 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.28 
 
 
610 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.54 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.1 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.61 
 
 
562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.65 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.14 
 
 
602 aa  134  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.65 
 
 
543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.4 
 
 
617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  30.64 
 
 
681 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.26 
 
 
609 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.64 
 
 
681 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.54 
 
 
607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.68 
 
 
693 aa  132  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31 
 
 
607 aa  132  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.65 
 
 
592 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.56 
 
 
609 aa  132  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.56 
 
 
611 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.91 
 
 
626 aa  132  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.56 
 
 
609 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.97 
 
 
617 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.56 
 
 
611 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.56 
 
 
609 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.29 
 
 
631 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.88 
 
 
714 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.7 
 
 
656 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2113  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.81 
 
 
481 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710868  normal  0.458371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.28 
 
 
609 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.24 
 
 
626 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.52 
 
 
724 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  28.98 
 
 
708 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.21 
 
 
613 aa  131  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.52 
 
 
721 aa  131  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.56 
 
 
611 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.79 
 
 
607 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.05 
 
 
598 aa  130  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.22 
 
 
594 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  28.82 
 
 
679 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  29.28 
 
 
611 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.69 
 
 
658 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  28.99 
 
 
608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  28.37 
 
 
608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  30.4 
 
 
613 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.69 
 
 
647 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.75 
 
 
615 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  26.7 
 
 
734 aa  130  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.01 
 
 
611 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.01 
 
 
611 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.41 
 
 
633 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.87 
 
 
619 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29 
 
 
634 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.75 
 
 
615 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  29.28 
 
 
609 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.09 
 
 
603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.87 
 
 
606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.73 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.3 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.65 
 
 
637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.4 
 
 
629 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.73 
 
 
599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.23 
 
 
600 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.88 
 
 
706 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32 
 
 
543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.69 
 
 
763 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.61 
 
 
611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>