More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2792 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
552 aa  1137    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51 
 
 
568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.51 
 
 
562 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.96 
 
 
545 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.16 
 
 
624 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.77 
 
 
535 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.08 
 
 
546 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.97 
 
 
543 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.78 
 
 
543 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.78 
 
 
543 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1009  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.11 
 
 
571 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.752624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.49 
 
 
563 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.41 
 
 
646 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.41 
 
 
793 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.64 
 
 
602 aa  339  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.55 
 
 
716 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.06 
 
 
598 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.35 
 
 
1376 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.38 
 
 
705 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.24 
 
 
708 aa  319  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.08 
 
 
590 aa  316  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.81 
 
 
557 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.82 
 
 
556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.08 
 
 
607 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.25 
 
 
590 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 
630 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
509 aa  302  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
509 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
509 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 
707 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.6 
 
 
601 aa  300  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.67 
 
 
509 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 
607 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 
594 aa  297  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.88 
 
 
497 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
728 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.56 
 
 
509 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.56 
 
 
509 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.56 
 
 
509 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 
479 aa  296  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
705 aa  296  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  35.56 
 
 
509 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
626 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.84 
 
 
603 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.72 
 
 
588 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 
681 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
705 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.8 
 
 
599 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 
509 aa  293  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  42.19 
 
 
597 aa  293  7e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
706 aa  292  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
705 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
705 aa  290  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
705 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  43.39 
 
 
615 aa  289  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  40.29 
 
 
705 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  40.29 
 
 
705 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 
609 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.04 
 
 
717 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
705 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.85 
 
 
503 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.8 
 
 
611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 
611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 
609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 
609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.82 
 
 
599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  41.8 
 
 
611 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.62 
 
 
602 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  41.8 
 
 
609 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.9 
 
 
607 aa  287  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  38.33 
 
 
690 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 
705 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 
705 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.52 
 
 
608 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 
609 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 
611 aa  286  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.25 
 
 
609 aa  286  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.28 
 
 
615 aa  286  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.53 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.24 
 
 
599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.98 
 
 
607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
602 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.23 
 
 
608 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  44.54 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.54 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.98 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
615 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.55 
 
 
707 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.28 
 
 
607 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.8 
 
 
614 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
615 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 
681 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  42.4 
 
 
698 aa  283  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.48 
 
 
679 aa  283  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
615 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.88 
 
 
737 aa  283  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.91 
 
 
725 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  39.24 
 
 
654 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.52 
 
 
610 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  42.2 
 
 
724 aa  281  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>