More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6295 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 590 aa  1188    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.97 
 
 		 630 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.21 
 
 		 602 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.89 
 
 		 590 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.5 
 
 		 607 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.91 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.09 
 
 		 556 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.65 
 
 		 646 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.08 
 
 		 1376 aa  353  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.39 
 
 		 568 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.79 
 
 		 563 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.78 
 
 		 793 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.56 
 
 		 716 aa  318  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.7 
 
 		 552 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.95 
 
 		 626 aa  310  5.9999999999999995e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.44 
 
 		 708 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.64 
 
 		 592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.8 
 
 		 617 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 		 593 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 		 593 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 		 707 aa  300  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  45.8 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 		 543 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.24 
 
 		 635 aa  297  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.83 
 
 		 543 aa  296  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.83 
 
 		 543 aa  296  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 		 728 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 724 aa  296  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.48 
 
 		 593 aa  295  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 		 594 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.45 
 
 		 721 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.49 
 
 		 562 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.52 
 
 		 725 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 		 607 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.42 
 
 		 535 aa  290  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  45.28 
 
 		 637 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.56 
 
 		 546 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 		 607 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 		 705 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 		 642 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 		 705 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 		 706 aa  287  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 		 705 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.34 
 
 		 705 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  42.06 
 
 		 705 aa  286  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.34 
 
 		 705 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  41.76 
 
 		 705 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  42.94 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.01 
 
 		 714 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.14 
 
 		 607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.67 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 		 737 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.62 
 
 		 705 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 		 705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.48 
 
 		 607 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.28 
 
 		 624 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.11 
 
 		 607 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.05 
 
 		 613 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 		 705 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.4 
 
 		 653 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 607 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  41.88 
 
 		 690 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.3 
 
 		 592 aa  283  9e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.57 
 
 		 641 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  43.23 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.66 
 
 		 681 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 634 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.64 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  40 
 
 		 654 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  37.87 
 
 		 641 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.39 
 
 		 864 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  48.19 
 
 		 681 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.19 
 
 		 681 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.95 
 
 		 641 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 		 736 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 607 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.5 
 
 		 545 aa  280  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.06 
 
 		 649 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 		 662 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 		 419 aa  279  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.88 
 
 		 662 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.2 
 
 		 679 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.38 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  36.32 
 
 		 648 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.56 
 
 		 615 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.88 
 
 		 662 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.13 
 
 		 664 aa  278  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.22 
 
 		 503 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.26 
 
 		 642 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.13 
 
 		 614 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.53 
 
 		 451 aa  277  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  40.11 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.33 
 
 		 598 aa  277  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>