More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2238 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  54.52 
 
 		 654 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  55.92 
 
 		 642 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.73 
 
 		 641 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.25 
 
 		 649 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.89 
 
 		 642 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.39 
 
 		 642 aa  744    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  53.72 
 
 		 639 aa  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.08 
 
 		 662 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.59 
 
 		 659 aa  646    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.34 
 
 		 653 aa  701    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.96 
 
 		 645 aa  828    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.76 
 
 		 664 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.4 
 
 		 662 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.29 
 
 		 681 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  60.94 
 
 		 636 aa  804    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.1 
 
 		 658 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.13 
 
 		 665 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  52.59 
 
 		 679 aa  678    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  53 
 
 		 669 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  64.9 
 
 		 648 aa  849    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.56 
 
 		 662 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.25 
 
 		 662 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.98 
 
 		 658 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 641 aa  1331    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  54.77 
 
 		 641 aa  690    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  50.82 
 
 		 690 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.45 
 
 		 651 aa  598  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.72 
 
 		 646 aa  591  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  39.18 
 
 		 637 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.92 
 
 		 632 aa  331  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.32 
 
 		 716 aa  304  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.16 
 
 		 679 aa  303  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.82 
 
 		 729 aa  300  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 		 705 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.96 
 
 		 617 aa  297  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.37 
 
 		 681 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  44.08 
 
 		 705 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  44.08 
 
 		 705 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 		 705 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 		 705 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.18 
 
 		 617 aa  296  6e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.79 
 
 		 705 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.79 
 
 		 705 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.21 
 
 		 685 aa  295  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.95 
 
 		 706 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.34 
 
 		 790 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.79 
 
 		 705 aa  294  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 594 aa  294  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.88 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  43.99 
 
 		 681 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.16 
 
 		 615 aa  293  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.99 
 
 		 681 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.35 
 
 		 626 aa  293  7e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.17 
 
 		 599 aa  293  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.87 
 
 		 419 aa  292  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 707 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.05 
 
 		 451 aa  292  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.26 
 
 		 607 aa  291  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.19 
 
 		 593 aa  291  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 		 633 aa  291  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.65 
 
 		 737 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.04 
 
 		 647 aa  290  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.15 
 
 		 610 aa  290  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.26 
 
 		 602 aa  289  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.38 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 		 679 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 		 615 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.18 
 
 		 707 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.44 
 
 		 721 aa  287  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.44 
 
 		 724 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.98 
 
 		 607 aa  286  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 		 705 aa  286  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.6 
 
 		 607 aa  286  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  42.77 
 
 		 698 aa  286  9e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 607 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.12 
 
 		 598 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.3 
 
 		 608 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.52 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 		 609 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 		 609 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 		 609 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  41.52 
 
 		 611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  41.52 
 
 		 609 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  44.23 
 
 		 621 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 		 606 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 		 608 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.23 
 
 		 731 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 		 611 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 		 607 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.33 
 
 		 779 aa  283  9e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.44 
 
 		 592 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.43 
 
 		 615 aa  283  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.85 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.82 
 
 		 620 aa  283  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.39 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>