More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1075 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
632 aa  1281    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.04 
 
 
642 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.69 
 
 
649 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.2 
 
 
653 aa  346  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.5 
 
 
664 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  33.75 
 
 
642 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.39 
 
 
641 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  33.6 
 
 
637 aa  329  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.78 
 
 
642 aa  326  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  32.24 
 
 
639 aa  323  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.25 
 
 
641 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  31.98 
 
 
679 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  30.42 
 
 
648 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.28 
 
 
645 aa  312  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  31.44 
 
 
641 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  31.56 
 
 
636 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.37 
 
 
651 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  30.5 
 
 
690 aa  303  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.65 
 
 
681 aa  300  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  31.05 
 
 
669 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.62 
 
 
658 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.63 
 
 
665 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.57 
 
 
658 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.34 
 
 
646 aa  289  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.3 
 
 
659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  30.63 
 
 
654 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.39 
 
 
662 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 
626 aa  283  7.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.21 
 
 
662 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.21 
 
 
662 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.97 
 
 
718 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.85 
 
 
662 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.63 
 
 
705 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.63 
 
 
707 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 
631 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 
714 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.69 
 
 
598 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.12 
 
 
611 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  38.59 
 
 
724 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
611 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
609 aa  270  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
609 aa  270  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.64 
 
 
593 aa  270  8e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.98 
 
 
779 aa  269  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
609 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.8 
 
 
527 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  43.12 
 
 
611 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.81 
 
 
611 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.8 
 
 
595 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  40.3 
 
 
698 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
609 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  43.12 
 
 
609 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 
614 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.51 
 
 
595 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 
615 aa  267  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.94 
 
 
607 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.82 
 
 
707 aa  266  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.44 
 
 
606 aa  266  8e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.59 
 
 
705 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.28 
 
 
616 aa  266  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.22 
 
 
605 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 
602 aa  265  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
609 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.57 
 
 
601 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.56 
 
 
617 aa  263  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.82 
 
 
707 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 
602 aa  263  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
705 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.02 
 
 
705 aa  263  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
615 aa  263  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
705 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.18 
 
 
606 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.65 
 
 
793 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.12 
 
 
731 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.94 
 
 
607 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 
712 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.94 
 
 
607 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
705 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.99 
 
 
674 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  40 
 
 
705 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 
610 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.94 
 
 
607 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.92 
 
 
711 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
615 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.94 
 
 
607 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 
597 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 
610 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
615 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 
615 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 
626 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 
596 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.75 
 
 
737 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.58 
 
 
625 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.81 
 
 
615 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
705 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.92 
 
 
709 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.03 
 
 
599 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  39.71 
 
 
705 aa  260  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.07 
 
 
729 aa  259  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.94 
 
 
607 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>