More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3741 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
705 aa  1385    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.59 
 
 
598 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.75 
 
 
716 aa  333  5e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  35.81 
 
 
615 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.82 
 
 
552 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.3 
 
 
737 aa  317  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.6 
 
 
679 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.28 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.73 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.67 
 
 
705 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.06 
 
 
590 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.32 
 
 
706 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.26 
 
 
709 aa  306  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.81 
 
 
709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.5 
 
 
705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.5 
 
 
705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.26 
 
 
602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.67 
 
 
705 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.67 
 
 
705 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.79 
 
 
613 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.05 
 
 
624 aa  305  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.67 
 
 
705 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.5 
 
 
705 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.77 
 
 
707 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  31.5 
 
 
705 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  31.33 
 
 
705 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.15 
 
 
610 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.15 
 
 
610 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.15 
 
 
597 aa  303  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.54 
 
 
1376 aa  303  9e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.71 
 
 
607 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.33 
 
 
705 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.55 
 
 
608 aa  301  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.71 
 
 
608 aa  301  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.28 
 
 
607 aa  300  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.71 
 
 
607 aa  300  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.41 
 
 
729 aa  299  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.89 
 
 
599 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 
607 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.11 
 
 
709 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.58 
 
 
617 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.18 
 
 
606 aa  298  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.02 
 
 
607 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.22 
 
 
674 aa  297  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  42.15 
 
 
639 aa  297  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.84 
 
 
611 aa  297  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.61 
 
 
607 aa  296  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 
611 aa  296  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.71 
 
 
607 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 
607 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 
607 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.14 
 
 
607 aa  296  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.02 
 
 
615 aa  296  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.67 
 
 
611 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 
611 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.59 
 
 
646 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 
609 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
611 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  40.69 
 
 
734 aa  295  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 
609 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  34.67 
 
 
609 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.42 
 
 
616 aa  295  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.12 
 
 
568 aa  294  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 
609 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  34.67 
 
 
611 aa  294  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.51 
 
 
609 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.22 
 
 
602 aa  293  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  36.82 
 
 
618 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.74 
 
 
736 aa  293  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.58 
 
 
718 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  41 
 
 
637 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 
602 aa  293  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
607 aa  292  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.65 
 
 
630 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 
711 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.68 
 
 
624 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.4 
 
 
790 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.78 
 
 
615 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.51 
 
 
599 aa  291  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.26 
 
 
619 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 
605 aa  291  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.32 
 
 
728 aa  291  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.05 
 
 
625 aa  291  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.44 
 
 
615 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.78 
 
 
615 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.78 
 
 
615 aa  290  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 
717 aa  290  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 
593 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.19 
 
 
707 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 
593 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 
620 aa  289  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.86 
 
 
651 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.73 
 
 
712 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.25 
 
 
626 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
625 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.52 
 
 
615 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.31 
 
 
653 aa  289  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.13 
 
 
607 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.61 
 
 
709 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>