More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0011 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
793 aa  1637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.94 
 
 
708 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.8 
 
 
716 aa  399  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.01 
 
 
598 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  32.74 
 
 
621 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.86 
 
 
681 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.8 
 
 
707 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 
602 aa  351  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.47 
 
 
630 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 
706 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.27 
 
 
705 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.27 
 
 
705 aa  340  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  49.56 
 
 
705 aa  340  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.56 
 
 
705 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.27 
 
 
705 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.98 
 
 
728 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.13 
 
 
705 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  49.56 
 
 
705 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.13 
 
 
705 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.27 
 
 
705 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.27 
 
 
705 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.07 
 
 
552 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.29 
 
 
503 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.41 
 
 
748 aa  335  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.57 
 
 
593 aa  331  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.25 
 
 
602 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.95 
 
 
563 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.07 
 
 
509 aa  325  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.55 
 
 
509 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.55 
 
 
509 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.96 
 
 
626 aa  324  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.35 
 
 
509 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  37.07 
 
 
509 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.4 
 
 
593 aa  323  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.4 
 
 
593 aa  323  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.35 
 
 
509 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.53 
 
 
592 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.95 
 
 
588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.07 
 
 
509 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.19 
 
 
497 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.59 
 
 
594 aa  320  7.999999999999999e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.46 
 
 
509 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.24 
 
 
724 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.86 
 
 
509 aa  318  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 
515 aa  317  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.66 
 
 
721 aa  316  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.51 
 
 
1376 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.8 
 
 
617 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.47 
 
 
729 aa  315  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  49.27 
 
 
597 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.66 
 
 
592 aa  313  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 
864 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.25 
 
 
607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.4 
 
 
590 aa  310  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.55 
 
 
714 aa  306  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.14 
 
 
562 aa  306  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.33 
 
 
646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.79 
 
 
602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.38 
 
 
590 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  47.2 
 
 
724 aa  302  1e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.15 
 
 
556 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
718 aa  300  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.83 
 
 
479 aa  300  6e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.57 
 
 
626 aa  300  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.03 
 
 
543 aa  300  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.12 
 
 
568 aa  299  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.28 
 
 
731 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.71 
 
 
709 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  44.87 
 
 
734 aa  298  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.71 
 
 
615 aa  296  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.9 
 
 
599 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.83 
 
 
543 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.83 
 
 
543 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  45.29 
 
 
690 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.9 
 
 
599 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.05 
 
 
729 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.19 
 
 
615 aa  294  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.3 
 
 
546 aa  294  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.79 
 
 
737 aa  293  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.82 
 
 
618 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
709 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.96 
 
 
656 aa  292  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.82 
 
 
733 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.06 
 
 
584 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
709 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.44 
 
 
535 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 
620 aa  291  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 
611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 
605 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  40.39 
 
 
639 aa  290  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.47 
 
 
651 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.97 
 
 
608 aa  290  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.9 
 
 
615 aa  290  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.13 
 
 
611 aa  289  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.93 
 
 
419 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.09 
 
 
619 aa  289  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.13 
 
 
609 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 
611 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.13 
 
 
609 aa  289  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.36 
 
 
731 aa  289  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>