More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2051 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 
637 aa  1305    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  39.97 
 
 
641 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.28 
 
 
642 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  40.16 
 
 
639 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.75 
 
 
641 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  41.21 
 
 
648 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 
649 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  42.03 
 
 
642 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.22 
 
 
645 aa  485  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.26 
 
 
653 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42 
 
 
662 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.16 
 
 
662 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.56 
 
 
662 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 
642 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.36 
 
 
662 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
659 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  40.25 
 
 
654 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  40.88 
 
 
636 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  41.8 
 
 
669 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  38.42 
 
 
679 aa  465  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 
646 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.61 
 
 
664 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.18 
 
 
641 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  37.48 
 
 
690 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.69 
 
 
658 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.37 
 
 
665 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.53 
 
 
658 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.56 
 
 
681 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.56 
 
 
651 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.9 
 
 
632 aa  332  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.91 
 
 
736 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.55 
 
 
737 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.33 
 
 
731 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.98 
 
 
716 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  47.19 
 
 
698 aa  323  5e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.13 
 
 
705 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  44.89 
 
 
734 aa  320  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.72 
 
 
634 aa  318  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.85 
 
 
603 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 
617 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.41 
 
 
631 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 
593 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 
593 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.22 
 
 
610 aa  317  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.07 
 
 
729 aa  316  7e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  48.75 
 
 
597 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.24 
 
 
714 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.99 
 
 
601 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.78 
 
 
596 aa  313  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 
615 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.29 
 
 
637 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.78 
 
 
599 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.48 
 
 
706 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 
594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.81 
 
 
864 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  46.47 
 
 
724 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.73 
 
 
606 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.77 
 
 
725 aa  310  6.999999999999999e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.9 
 
 
725 aa  310  6.999999999999999e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  45.58 
 
 
705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.32 
 
 
733 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 
705 aa  308  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 
705 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  45.58 
 
 
705 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 
705 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 
705 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.3 
 
 
705 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.3 
 
 
705 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  46.06 
 
 
615 aa  306  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.3 
 
 
705 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.3 
 
 
705 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 
599 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.57 
 
 
646 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.66 
 
 
729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 
707 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.14 
 
 
634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.55 
 
 
779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 
707 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.41 
 
 
607 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.54 
 
 
599 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 
709 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.54 
 
 
620 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.9 
 
 
710 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.8 
 
 
419 aa  302  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 
709 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  44.44 
 
 
493 aa  300  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.48 
 
 
717 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.69 
 
 
707 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.73 
 
 
626 aa  300  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.4 
 
 
630 aa  300  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.87 
 
 
630 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.26 
 
 
592 aa  300  6e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.05 
 
 
625 aa  300  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.36 
 
 
611 aa  300  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 
709 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.77 
 
 
647 aa  298  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.5 
 
 
607 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.32 
 
 
605 aa  297  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.25 
 
 
607 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.24 
 
 
709 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>