More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1902 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
630 aa  1291    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  46.43 
 
 
637 aa  610  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51.84 
 
 
642 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.39 
 
 
637 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.01 
 
 
634 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.41 
 
 
634 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  45.52 
 
 
632 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1831  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.52 
 
 
655 aa  503  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.28 
 
 
631 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.54 
 
 
633 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.26 
 
 
584 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.49 
 
 
707 aa  336  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.08 
 
 
731 aa  334  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.8 
 
 
709 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.8 
 
 
709 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.49 
 
 
709 aa  326  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.71 
 
 
601 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.05 
 
 
705 aa  324  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 
647 aa  323  5e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.27 
 
 
596 aa  320  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
718 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.05 
 
 
606 aa  319  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.68 
 
 
620 aa  319  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.63 
 
 
603 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.19 
 
 
717 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.58 
 
 
606 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.81 
 
 
626 aa  317  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.31 
 
 
709 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 
707 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  41.92 
 
 
698 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.54 
 
 
779 aa  312  9e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  46.71 
 
 
709 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.33 
 
 
451 aa  312  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  44.05 
 
 
597 aa  311  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.15 
 
 
601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.58 
 
 
611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 
602 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.47 
 
 
712 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 
610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 
721 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 
610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.9 
 
 
617 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.88 
 
 
597 aa  310  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  43.28 
 
 
611 aa  310  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.28 
 
 
611 aa  309  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.28 
 
 
609 aa  309  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.28 
 
 
611 aa  309  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.28 
 
 
609 aa  309  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  43.28 
 
 
609 aa  309  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.18 
 
 
711 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  44.35 
 
 
608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.31 
 
 
710 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.83 
 
 
725 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 
608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.53 
 
 
626 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.45 
 
 
599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.28 
 
 
609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.77 
 
 
611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.15 
 
 
599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.01 
 
 
707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.78 
 
 
715 aa  308  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.78 
 
 
714 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.15 
 
 
608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.11 
 
 
709 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.81 
 
 
724 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.07 
 
 
615 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.16 
 
 
633 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  43.53 
 
 
608 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.66 
 
 
716 aa  306  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.92 
 
 
419 aa  306  7e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 
617 aa  306  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.17 
 
 
612 aa  306  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.99 
 
 
609 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.71 
 
 
625 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  45.85 
 
 
601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 
615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.78 
 
 
594 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 
605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.58 
 
 
609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
615 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
615 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.51 
 
 
611 aa  303  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
607 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
615 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
615 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.51 
 
 
715 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.51 
 
 
715 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 
706 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.15 
 
 
715 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.24 
 
 
615 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.95 
 
 
881 aa  301  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.51 
 
 
714 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.97 
 
 
592 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.64 
 
 
619 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 
599 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.14 
 
 
685 aa  300  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.85 
 
 
674 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.81 
 
 
625 aa  300  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 
602 aa  300  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>