More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1831 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1831  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
655 aa  1350    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  43.68 
 
 
637 aa  531  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.52 
 
 
630 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.21 
 
 
637 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.88 
 
 
634 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.58 
 
 
642 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.87 
 
 
634 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 
631 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  40.29 
 
 
632 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.1 
 
 
633 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.81 
 
 
584 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.78 
 
 
615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.92 
 
 
707 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.32 
 
 
617 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.7 
 
 
620 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.89 
 
 
731 aa  303  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 
633 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.59 
 
 
707 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.08 
 
 
626 aa  297  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.58 
 
 
594 aa  295  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 
610 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 
597 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 
610 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
728 aa  293  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.38 
 
 
709 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 
608 aa  291  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
709 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.66 
 
 
709 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.8 
 
 
709 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 
620 aa  290  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.67 
 
 
608 aa  290  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 
607 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.93 
 
 
718 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
609 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.95 
 
 
681 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  40.76 
 
 
608 aa  288  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.62 
 
 
611 aa  287  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 
611 aa  287  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 
607 aa  287  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 
609 aa  287  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 
705 aa  287  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 
611 aa  287  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 
609 aa  287  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 
609 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  43.62 
 
 
611 aa  286  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  43.62 
 
 
609 aa  286  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 
705 aa  286  9e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.46 
 
 
617 aa  286  9e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.67 
 
 
609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 
607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.4 
 
 
642 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.59 
 
 
625 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.48 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.09 
 
 
653 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.59 
 
 
647 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 
591 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 
602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.25 
 
 
590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.32 
 
 
614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 
709 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 
599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  43.24 
 
 
705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 
705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.89 
 
 
611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  40.51 
 
 
608 aa  284  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  44.14 
 
 
597 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 
705 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  43.24 
 
 
705 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 
705 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.8 
 
 
602 aa  283  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 
705 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.19 
 
 
626 aa  283  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
705 aa  283  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  31.4 
 
 
648 aa  283  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.53 
 
 
601 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  32.59 
 
 
637 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
615 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.73 
 
 
779 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.25 
 
 
709 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
615 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
705 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  42.39 
 
 
615 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
705 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  41.94 
 
 
639 aa  282  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.53 
 
 
606 aa  281  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.27 
 
 
706 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
615 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
615 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.62 
 
 
626 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
615 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 
624 aa  280  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 
715 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.57 
 
 
599 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 
715 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.11 
 
 
864 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 
715 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 
602 aa  280  5e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 
607 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>