More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1895 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 633 aa  1308    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  44.17 
 
 		 632 aa  535  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.25 
 
 		 634 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.54 
 
 		 630 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  38 
 
 		 637 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.12 
 
 		 642 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.98 
 
 		 637 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.51 
 
 		 634 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_002950  PG1831  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.1 
 
 		 655 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.87 
 
 		 718 aa  323  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 625 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.71 
 
 		 709 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.09 
 
 		 709 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.09 
 
 		 709 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.75 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.67 
 
 		 599 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.06 
 
 		 731 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.76 
 
 		 717 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.96 
 
 		 710 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.9 
 
 		 707 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 		 599 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 		 617 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 		 601 aa  307  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 626 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  45.16 
 
 		 734 aa  306  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 		 603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 		 714 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 709 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.36 
 
 		 609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 		 617 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 709 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.18 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.11 
 
 		 729 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.23 
 
 		 606 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  45.4 
 
 		 601 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.48 
 
 		 596 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.42 
 
 		 622 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 707 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.57 
 
 		 633 aa  300  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.89 
 
 		 709 aa  300  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.19 
 
 		 731 aa  299  9e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 		 712 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.41 
 
 		 779 aa  299  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.42 
 
 		 621 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 		 707 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.4 
 
 		 711 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 		 618 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  44.55 
 
 		 724 aa  297  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.52 
 
 		 606 aa  297  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.65 
 
 		 715 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 		 729 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.34 
 
 		 605 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 		 615 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.4 
 
 		 737 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.6 
 
 		 607 aa  296  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  43.1 
 
 		 608 aa  296  7e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 		 736 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.91 
 
 		 728 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  42.44 
 
 		 705 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  42.44 
 
 		 705 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 		 705 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  43.1 
 
 		 608 aa  293  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.27 
 
 		 725 aa  293  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 		 705 aa  293  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 		 705 aa  293  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 		 616 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 		 715 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 		 715 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 		 714 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 		 715 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.15 
 
 		 705 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.46 
 
 		 705 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.15 
 
 		 705 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 		 706 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.56 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 		 594 aa  291  3e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.86 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.72 
 
 		 607 aa  291  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.25 
 
 		 615 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.82 
 
 		 725 aa  291  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.96 
 
 		 639 aa  291  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 601 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.15 
 
 		 705 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.84 
 
 		 625 aa  290  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.44 
 
 		 633 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  41.21 
 
 		 618 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.05 
 
 		 615 aa  290  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.61 
 
 		 617 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.85 
 
 		 647 aa  289  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.33 
 
 		 630 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.15 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  45.15 
 
 		 600 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.15 
 
 		 600 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  42.9 
 
 		 628 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>