More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2442 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 606 aa  1258    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.24 
 
 		 605 aa  609  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 		 606 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 603 aa  558  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.16 
 
 		 596 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.44 
 
 		 451 aa  557  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.79 
 
 		 714 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.84 
 
 		 601 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.82 
 
 		 715 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.06 
 
 		 599 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.9 
 
 		 599 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.95 
 
 		 602 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.36 
 
 		 611 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.45 
 
 		 610 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.09 
 
 		 615 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.22 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.43 
 
 		 881 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.76 
 
 		 613 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 		 647 aa  510  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 		 731 aa  508  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.22 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.39 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.95 
 
 		 607 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 		 624 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 608 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.22 
 
 		 607 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 614 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.21 
 
 		 707 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.58 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.7 
 
 		 599 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.94 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.28 
 
 		 608 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 620 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.72 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.92 
 
 		 608 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.05 
 
 		 611 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.41 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.5 
 
 		 609 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  42.71 
 
 		 611 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.88 
 
 		 611 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.64 
 
 		 601 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.43 
 
 		 611 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  42.35 
 
 		 600 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 609 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43 
 
 		 711 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.35 
 
 		 600 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 609 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 609 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  42.71 
 
 		 609 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 611 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.68 
 
 		 712 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.19 
 
 		 615 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 609 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 615 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.52 
 
 		 715 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 		 598 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 715 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 615 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.56 
 
 		 629 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  43.53 
 
 		 601 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.68 
 
 		 611 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.68 
 
 		 611 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.25 
 
 		 612 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.35 
 
 		 715 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.14 
 
 		 709 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.95 
 
 		 597 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  42.31 
 
 		 608 aa  492  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 		 718 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.95 
 
 		 610 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.95 
 
 		 610 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43 
 
 		 707 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.36 
 
 		 601 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.17 
 
 		 779 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.85 
 
 		 615 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 710 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  41.81 
 
 		 709 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.85 
 
 		 711 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 		 625 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 		 602 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.3 
 
 		 612 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  42.03 
 
 		 608 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.19 
 
 		 674 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.14 
 
 		 603 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.1 
 
 		 724 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.31 
 
 		 633 aa  485  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 625 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 		 719 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  41.15 
 
 		 618 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 		 709 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 		 709 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.96 
 
 		 721 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>