More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1171 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 881 aa  1820    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.22 
 
 		 647 aa  729    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 		 709 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.86 
 
 		 731 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.33 
 
 		 718 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.85 
 
 		 709 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.85 
 
 		 709 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.16 
 
 		 605 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.99 
 
 		 722 aa  578  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.15 
 
 		 603 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.37 
 
 		 601 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.88 
 
 		 596 aa  562  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.51 
 
 		 599 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.38 
 
 		 617 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.33 
 
 		 612 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.64 
 
 		 606 aa  555  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.2 
 
 		 599 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 714 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.81 
 
 		 717 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.13 
 
 		 715 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.03 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.27 
 
 		 611 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  45.03 
 
 		 601 aa  545  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  43.8 
 
 		 608 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  43.33 
 
 		 608 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 		 620 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.5 
 
 		 674 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  42.48 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.48 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.48 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  43.18 
 
 		 615 aa  535  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.48 
 
 		 609 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.48 
 
 		 609 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  42.48 
 
 		 609 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 		 609 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.48 
 
 		 609 aa  534  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.98 
 
 		 625 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.77 
 
 		 614 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.45 
 
 		 611 aa  532  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.11 
 
 		 707 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 		 611 aa  532  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.73 
 
 		 610 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.52 
 
 		 615 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 615 aa  529  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 		 599 aa  528  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.67 
 
 		 597 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.73 
 
 		 610 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.38 
 
 		 619 aa  529  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 		 609 aa  529  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 615 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 615 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.63 
 
 		 602 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 599 aa  522  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.54 
 
 		 608 aa  522  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 		 607 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.15 
 
 		 613 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.38 
 
 		 608 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.2 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.31 
 
 		 711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.51 
 
 		 625 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.73 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.54 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 		 607 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.68 
 
 		 616 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 		 615 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.13 
 
 		 607 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 		 607 aa  515  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.91 
 
 		 719 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.42 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.43 
 
 		 606 aa  511  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 		 610 aa  512  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.57 
 
 		 607 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 608 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.39 
 
 		 594 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 		 624 aa  508  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.6 
 
 		 633 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.23 
 
 		 736 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.05 
 
 		 709 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.68 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.69 
 
 		 748 aa  505  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 737 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.77 
 
 		 617 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.78 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.02 
 
 		 626 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 		 725 aa  502  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 		 705 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.57 
 
 		 714 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.88 
 
 		 629 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  41.21 
 
 		 618 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.2 
 
 		 707 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 		 611 aa  499  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 		 611 aa  499  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 		 602 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.53 
 
 		 611 aa  499  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.36 
 
 		 733 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>