More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0775 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.12 
 
 
736 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.4 
 
 
725 aa  816    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.04 
 
 
737 aa  810    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.07 
 
 
729 aa  833    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  49.45 
 
 
724 aa  704    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  55.9 
 
 
734 aa  850    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
733 aa  1515    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.95 
 
 
725 aa  786    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.1 
 
 
729 aa  832    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.25 
 
 
731 aa  811    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.24 
 
 
718 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 
731 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.36 
 
 
881 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.01 
 
 
619 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
674 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.05 
 
 
599 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.08 
 
 
599 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  41.02 
 
 
615 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.6 
 
 
615 aa  484  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
598 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.24 
 
 
709 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.82 
 
 
599 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.87 
 
 
606 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 
709 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 
608 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.55 
 
 
709 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.77 
 
 
603 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.52 
 
 
617 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.26 
 
 
611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 
610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.2 
 
 
596 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.87 
 
 
601 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 
610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
615 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.1 
 
 
600 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 
599 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.73 
 
 
601 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.44 
 
 
600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.72 
 
 
608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  40.1 
 
 
611 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  40.44 
 
 
600 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
609 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.22 
 
 
739 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 
597 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  40.1 
 
 
609 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.13 
 
 
599 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.46 
 
 
609 aa  465  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.56 
 
 
633 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.34 
 
 
605 aa  465  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 
607 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.63 
 
 
625 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 
620 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.34 
 
 
621 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  40.13 
 
 
601 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.43 
 
 
607 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.31 
 
 
611 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.08 
 
 
606 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 
622 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 
601 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.34 
 
 
705 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.06 
 
 
779 aa  459  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.51 
 
 
717 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.8 
 
 
602 aa  462  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  37.98 
 
 
698 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.65 
 
 
625 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 
715 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.31 
 
 
709 aa  458  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
715 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 
624 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.14 
 
 
614 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 
715 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.21 
 
 
709 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  38.27 
 
 
608 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  38.44 
 
 
608 aa  455  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38 
 
 
711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.36 
 
 
722 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.59 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.59 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.74 
 
 
611 aa  456  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.86 
 
 
647 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.64 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.37 
 
 
714 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 
710 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.38 
 
 
748 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  39.9 
 
 
628 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  39.04 
 
 
709 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 
612 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  38.65 
 
 
618 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.02 
 
 
616 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.89 
 
 
625 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.08 
 
 
714 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>