More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1092 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 451 aa  929    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.44 
 
 		 606 aa  557  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.5 
 
 		 605 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.85 
 
 		 606 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  52.41 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.52 
 
 		 596 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.55 
 
 		 603 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.54 
 
 		 601 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.28 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.13 
 
 		 881 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.29 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.29 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.61 
 
 		 647 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.38 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.28 
 
 		 714 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.48 
 
 		 599 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.63 
 
 		 602 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.76 
 
 		 715 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.18 
 
 		 779 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.25 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.62 
 
 		 731 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.79 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 		 707 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.23 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.48 
 
 		 621 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.41 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.51 
 
 		 601 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.7 
 
 		 600 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.76 
 
 		 707 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  46.7 
 
 		 600 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.74 
 
 		 612 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.96 
 
 		 647 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.32 
 
 		 622 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.24 
 
 		 619 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 633 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.48 
 
 		 712 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 711 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.08 
 
 		 616 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.1 
 
 		 705 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.75 
 
 		 615 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.74 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.76 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.95 
 
 		 717 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.28 
 
 		 609 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.47 
 
 		 625 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.23 
 
 		 599 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.49 
 
 		 615 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.92 
 
 		 605 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.14 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  46.72 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.96 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.06 
 
 		 709 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.3 
 
 		 709 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.72 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.63 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.3 
 
 		 657 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.2 
 
 		 615 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.14 
 
 		 647 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 625 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.72 
 
 		 609 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.55 
 
 		 709 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 644 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  46.54 
 
 		 618 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.96 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.38 
 
 		 615 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.2 
 
 		 615 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.72 
 
 		 609 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.84 
 
 		 728 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.38 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.14 
 
 		 763 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.72 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.47 
 
 		 625 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.72 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  48.73 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.2 
 
 		 615 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.81 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.73 
 
 		 711 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  48.46 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.2 
 
 		 615 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.13 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.49 
 
 		 737 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.25 
 
 		 725 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.25 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 615 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.23 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 		 710 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.04 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.21 
 
 		 718 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.62 
 
 		 709 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.71 
 
 		 714 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.32 
 
 		 608 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>