More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1309 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.21 
 
 
637 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.24 
 
 
642 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  100 
 
 
637 aa  1323    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.43 
 
 
630 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.48 
 
 
634 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.33 
 
 
634 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1831  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.68 
 
 
655 aa  511  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  40.39 
 
 
632 aa  478  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38 
 
 
633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.14 
 
 
631 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.43 
 
 
584 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.52 
 
 
718 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.15 
 
 
419 aa  318  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.4 
 
 
709 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.67 
 
 
620 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.88 
 
 
594 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 
625 aa  313  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 
611 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.16 
 
 
725 aa  312  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 
707 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 
610 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 
610 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.19 
 
 
602 aa  310  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 
597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  46.52 
 
 
597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.84 
 
 
731 aa  309  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.48 
 
 
592 aa  309  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.96 
 
 
607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.38 
 
 
608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.29 
 
 
647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.15 
 
 
707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.97 
 
 
601 aa  308  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 
607 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.09 
 
 
608 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.14 
 
 
606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.13 
 
 
716 aa  304  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.1 
 
 
724 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.44 
 
 
615 aa  303  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.04 
 
 
605 aa  303  7.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.52 
 
 
599 aa  302  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 
721 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.07 
 
 
617 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.65 
 
 
611 aa  302  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.25 
 
 
626 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.4 
 
 
714 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.64 
 
 
599 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.82 
 
 
602 aa  300  6e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
603 aa  300  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.43 
 
 
633 aa  300  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.94 
 
 
599 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 
618 aa  299  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.45 
 
 
707 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  40.73 
 
 
615 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 
607 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
617 aa  298  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 
647 aa  298  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 
705 aa  298  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.06 
 
 
608 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 
607 aa  298  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.45 
 
 
709 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.46 
 
 
606 aa  297  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.78 
 
 
619 aa  297  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  42.62 
 
 
709 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 
607 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.54 
 
 
614 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 
607 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 
607 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 
705 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 
709 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.29 
 
 
592 aa  295  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 
705 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 
709 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 
607 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 
705 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 
607 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 
705 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.76 
 
 
593 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
607 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.15 
 
 
779 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.64 
 
 
624 aa  295  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 
705 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.76 
 
 
593 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.32 
 
 
706 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  44.71 
 
 
705 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 
626 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 
736 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
613 aa  294  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.29 
 
 
607 aa  294  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.63 
 
 
710 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 
607 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.06 
 
 
607 aa  293  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  44.71 
 
 
705 aa  293  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 
622 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 
705 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 
705 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.78 
 
 
709 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.11 
 
 
596 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.66 
 
 
731 aa  292  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 
705 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.03 
 
 
615 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>