More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01900 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  100 
 
 		 698 aa  1448    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.91 
 
 		 705 aa  795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 707 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.16 
 
 		 717 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.79 
 
 		 714 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.88 
 
 		 603 aa  548  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.18 
 
 		 596 aa  545  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  47.14 
 
 		 601 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 		 602 aa  532  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.63 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.31 
 
 		 601 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 		 611 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.8 
 
 		 599 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.78 
 
 		 715 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.72 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.08 
 
 		 601 aa  525  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.16 
 
 		 620 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  47.03 
 
 		 608 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  46.52 
 
 		 608 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  44.69 
 
 		 611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.86 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.42 
 
 		 608 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.22 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  44.69 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 		 711 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.69 
 
 		 611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.6 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.77 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.65 
 
 		 607 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 		 607 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.42 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 		 625 aa  515  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 		 613 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.42 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.65 
 
 		 599 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 		 615 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.43 
 
 		 607 aa  515  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.46 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.82 
 
 		 609 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.99 
 
 		 624 aa  512  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.91 
 
 		 610 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.33 
 
 		 610 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.33 
 
 		 610 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.18 
 
 		 615 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.12 
 
 		 718 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.48 
 
 		 615 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 		 607 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.2 
 
 		 615 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.05 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.05 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.18 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.18 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.01 
 
 		 615 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.05 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.2 
 
 		 724 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.05 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.12 
 
 		 608 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.89 
 
 		 721 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.16 
 
 		 731 aa  500  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 		 707 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 625 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 		 709 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.76 
 
 		 607 aa  498  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.03 
 
 		 709 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.22 
 
 		 614 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.55 
 
 		 710 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.18 
 
 		 609 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.25 
 
 		 647 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.42 
 
 		 626 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.52 
 
 		 712 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.43 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 		 705 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 		 705 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 		 705 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 		 705 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.4 
 
 		 881 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 		 705 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.36 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 		 674 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 		 705 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.2 
 
 		 719 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  43.29 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  38.65 
 
 		 705 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  38.65 
 
 		 705 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.98 
 
 		 779 aa  483  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.16 
 
 		 617 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.82 
 
 		 715 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.78 
 
 		 748 aa  485  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 		 616 aa  482  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.54 
 
 		 790 aa  485  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 611 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>