More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1455 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.35 
 
 		 659 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  50.87 
 
 		 690 aa  694    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  53.91 
 
 		 654 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  49.63 
 
 		 679 aa  681    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  51.91 
 
 		 641 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.4 
 
 		 641 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.79 
 
 		 662 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.63 
 
 		 662 aa  695    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.2 
 
 		 642 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.79 
 
 		 662 aa  696    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 651 aa  1358    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.01 
 
 		 681 aa  712    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.63 
 
 		 662 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.06 
 
 		 658 aa  718    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.99 
 
 		 665 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  52.33 
 
 		 669 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.52 
 
 		 658 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 664 aa  634  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  51.86 
 
 		 639 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.17 
 
 		 646 aa  631  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 649 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.92 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  49.54 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.99 
 
 		 645 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  49.84 
 
 		 648 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 653 aa  598  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.45 
 
 		 641 aa  598  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  48.57 
 
 		 636 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  37.36 
 
 		 637 aa  405  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.05 
 
 		 617 aa  302  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  44.31 
 
 		 615 aa  296  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.01 
 
 		 632 aa  296  8e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.19 
 
 		 593 aa  294  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 		 709 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.21 
 
 		 709 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 626 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.54 
 
 		 718 aa  291  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.47 
 
 		 793 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42 
 
 		 737 aa  286  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.13 
 
 		 674 aa  286  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.85 
 
 		 709 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.63 
 
 		 634 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 599 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.87 
 
 		 864 aa  283  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.15 
 
 		 716 aa  283  9e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.04 
 
 		 705 aa  283  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.51 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 		 602 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 729 aa  281  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.68 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.36 
 
 		 607 aa  280  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  43.88 
 
 		 621 aa  280  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  42.74 
 
 		 698 aa  280  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.92 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 		 614 aa  280  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 		 594 aa  280  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.4 
 
 		 606 aa  280  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.14 
 
 		 615 aa  279  9e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 607 aa  279  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 		 602 aa  278  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.82 
 
 		 606 aa  277  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 		 608 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 		 615 aa  276  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 		 707 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 		 620 aa  276  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 609 aa  276  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  40.22 
 
 		 611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.94 
 
 		 611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.93 
 
 		 617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.86 
 
 		 725 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.96 
 
 		 599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  40.22 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.17 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.51 
 
 		 608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 		 608 aa  275  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.42 
 
 		 615 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 		 611 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 		 451 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 609 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.12 
 
 		 626 aa  274  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.32 
 
 		 600 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.54 
 
 		 607 aa  273  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.52 
 
 		 714 aa  273  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.42 
 
 		 615 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.84 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.94 
 
 		 679 aa  272  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 		 615 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.42 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.42 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.42 
 
 		 615 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.32 
 
 		 599 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  41.38 
 
 		 724 aa  270  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 		 736 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 		 607 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>