More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1542 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 592 aa  1190    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  98.14 
 
 		 592 aa  1176    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.62 
 
 		 724 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.79 
 
 		 721 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.75 
 
 		 707 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.37 
 
 		 592 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 		 728 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 		 705 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 		 705 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 		 705 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  42.24 
 
 		 705 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  42.24 
 
 		 705 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.63 
 
 		 706 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 		 705 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.9 
 
 		 705 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.9 
 
 		 705 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 		 705 aa  502  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 		 705 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 		 594 aa  498  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.36 
 
 		 615 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.89 
 
 		 593 aa  456  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.3 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.88 
 
 		 599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 		 626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.94 
 
 		 617 aa  450  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.71 
 
 		 599 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 		 611 aa  452  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.22 
 
 		 624 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.86 
 
 		 603 aa  445  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.12 
 
 		 617 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.63 
 
 		 608 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 		 599 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 		 607 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.46 
 
 		 608 aa  442  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.07 
 
 		 674 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.21 
 
 		 599 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  38.73 
 
 		 615 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.98 
 
 		 602 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.51 
 
 		 715 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.95 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.07 
 
 		 602 aa  437  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.95 
 
 		 607 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.56 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.99 
 
 		 607 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.82 
 
 		 610 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.48 
 
 		 601 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.82 
 
 		 610 aa  435  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.78 
 
 		 607 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 		 597 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.26 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.04 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.46 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.44 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.19 
 
 		 602 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.66 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.99 
 
 		 611 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38 
 
 		 612 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.59 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 		 709 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.16 
 
 		 625 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  37.58 
 
 		 608 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  37.31 
 
 		 608 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.47 
 
 		 607 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.97 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.14 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.52 
 
 		 613 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.62 
 
 		 601 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.78 
 
 		 610 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.44 
 
 		 607 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.92 
 
 		 714 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.26 
 
 		 620 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.23 
 
 		 881 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 		 593 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.19 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 		 608 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  37.14 
 
 		 597 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 		 593 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 		 592 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.5 
 
 		 719 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.3 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.43 
 
 		 600 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.85 
 
 		 625 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  36.43 
 
 		 600 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.56 
 
 		 616 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 		 779 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 731 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.05 
 
 		 625 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.06 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  37.12 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 		 601 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 		 619 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.83 
 
 		 718 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.82 
 
 		 611 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.82 
 
 		 611 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.08 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>