More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3149 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
1376 aa  2729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.94 
 
 
646 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.77 
 
 
716 aa  375  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.06 
 
 
588 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.89 
 
 
602 aa  373  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.45 
 
 
630 aa  365  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.08 
 
 
590 aa  363  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 
607 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.44 
 
 
556 aa  341  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.9 
 
 
563 aa  331  7e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.26 
 
 
590 aa  330  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.28 
 
 
626 aa  322  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.35 
 
 
552 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.41 
 
 
708 aa  312  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.51 
 
 
793 aa  311  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 
705 aa  310  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.68 
 
 
602 aa  308  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 
705 aa  308  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 
705 aa  308  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 
706 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  41.23 
 
 
705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  41.3 
 
 
705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.23 
 
 
705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 
705 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.23 
 
 
705 aa  305  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.23 
 
 
705 aa  305  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.23 
 
 
705 aa  304  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 
617 aa  301  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.13 
 
 
728 aa  299  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 
594 aa  296  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.97 
 
 
535 aa  295  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.84 
 
 
543 aa  294  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  42.12 
 
 
724 aa  294  7e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.34 
 
 
707 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
709 aa  291  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
709 aa  290  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.45 
 
 
705 aa  290  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.42 
 
 
543 aa  290  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.42 
 
 
543 aa  290  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.01 
 
 
724 aa  288  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.17 
 
 
509 aa  288  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  35.14 
 
 
509 aa  287  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.17 
 
 
509 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.17 
 
 
509 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.37 
 
 
593 aa  287  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.93 
 
 
509 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.07 
 
 
545 aa  286  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.3 
 
 
509 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.45 
 
 
721 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 
864 aa  285  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.29 
 
 
584 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 
718 aa  285  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.98 
 
 
592 aa  284  7.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.93 
 
 
509 aa  284  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.69 
 
 
592 aa  283  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.5 
 
 
546 aa  282  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  44.19 
 
 
597 aa  281  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.72 
 
 
509 aa  280  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.19 
 
 
568 aa  280  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.16 
 
 
606 aa  279  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.76 
 
 
709 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.82 
 
 
593 aa  278  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.82 
 
 
593 aa  278  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.15 
 
 
598 aa  278  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.6 
 
 
681 aa  276  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
707 aa  277  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.88 
 
 
714 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.09 
 
 
656 aa  275  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.22 
 
 
606 aa  275  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.23 
 
 
503 aa  275  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.46 
 
 
515 aa  275  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.21 
 
 
562 aa  275  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  41.44 
 
 
615 aa  273  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
729 aa  273  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.21 
 
 
509 aa  273  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.64 
 
 
633 aa  272  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.37 
 
 
705 aa  272  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.07 
 
 
617 aa  272  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  44.14 
 
 
621 aa  272  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.1 
 
 
642 aa  271  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.79 
 
 
497 aa  271  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 
712 aa  271  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.29 
 
 
710 aa  270  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.96 
 
 
602 aa  270  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.68 
 
 
731 aa  270  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.41 
 
 
737 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  39.83 
 
 
648 aa  270  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.68 
 
 
709 aa  270  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 
711 aa  270  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  39.78 
 
 
679 aa  269  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 
707 aa  269  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.94 
 
 
617 aa  268  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.66 
 
 
653 aa  268  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.26 
 
 
479 aa  268  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.23 
 
 
881 aa  268  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.85 
 
 
642 aa  268  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.13 
 
 
451 aa  268  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.31 
 
 
635 aa  268  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  37.79 
 
 
654 aa  267  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.96 
 
 
607 aa  267  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>