More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0948 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 562 aa  1142    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1009  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  68.88 
 
 		 571 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.752624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.18 
 
 		 543 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54 
 
 		 543 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54 
 
 		 543 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.29 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.36 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.69 
 
 		 546 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.32 
 
 		 624 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.51 
 
 		 552 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.63 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.68 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.1 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.41 
 
 		 602 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.14 
 
 		 793 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.88 
 
 		 716 aa  301  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.2 
 
 		 646 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.27 
 
 		 602 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 		 602 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.56 
 
 		 709 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.53 
 
 		 710 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.95 
 
 		 590 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.48 
 
 		 708 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.28 
 
 		 599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.21 
 
 		 1376 aa  283  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.1 
 
 		 615 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.79 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 		 609 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 		 707 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.02 
 
 		 611 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 		 609 aa  279  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.73 
 
 		 611 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 		 609 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 		 609 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.73 
 
 		 611 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 		 615 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  43.73 
 
 		 611 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 		 615 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.62 
 
 		 706 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  43.26 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.1 
 
 		 609 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 		 599 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 		 615 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  41.99 
 
 		 615 aa  277  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.31 
 
 		 615 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.58 
 
 		 620 aa  276  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.29 
 
 		 685 aa  276  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.32 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.54 
 
 		 705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.09 
 
 		 714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 		 626 aa  274  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.11 
 
 		 607 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.09 
 
 		 556 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.92 
 
 		 611 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 		 607 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.77 
 
 		 598 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 		 630 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.77 
 
 		 601 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.54 
 
 		 705 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.09 
 
 		 709 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.47 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  36.31 
 
 		 709 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 610 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 610 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.92 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.57 
 
 		 607 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.98 
 
 		 790 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.44 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 		 705 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  38.27 
 
 		 705 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 679 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.81 
 
 		 714 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.95 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  38.27 
 
 		 705 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.36 
 
 		 633 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.71 
 
 		 608 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 		 607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.27 
 
 		 509 aa  270  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.94 
 
 		 608 aa  270  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.67 
 
 		 588 aa  270  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.94 
 
 		 608 aa  269  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 		 614 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 		 715 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.47 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.49 
 
 		 590 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 		 625 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.09 
 
 		 715 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 		 607 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.34 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>