More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2641 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2641  helicase-like protein  100 
 
 		 831 aa  1671    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4391  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.6 
 
 		 842 aa  297  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2945  putative DEAD/DEAH box helicase  29.52 
 
 		 843 aa  253  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  25.88 
 
 		 563 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.43 
 
 		 705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  26.15 
 
 		 1376 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14845  predicted protein  27.91 
 
 		 440 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.73 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.65 
 
 		 562 aa  127  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  28.49 
 
 		 503 aa  125  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  26.88 
 
 		 641 aa  124  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.64 
 
 		 545 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  24.86 
 
 		 646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.61 
 
 		 631 aa  120  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.83 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.55 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  28.33 
 
 		 637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.83 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.45 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2113  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.53 
 
 		 481 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710868  normal  0.458371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.23 
 
 		 598 aa  119  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.76 
 
 		 641 aa  118  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.37 
 
 		 610 aa  118  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  26.92 
 
 		 497 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.64 
 
 		 584 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.31 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  26.78 
 
 		 568 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.97 
 
 		 708 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.97 
 
 		 509 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.76 
 
 		 515 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  28.65 
 
 		 632 aa  113  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.97 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.97 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  27.25 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  25.97 
 
 		 509 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.2 
 
 		 649 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.02 
 
 		 607 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.13 
 
 		 479 aa  111  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3363  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1677 aa  111  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.12 
 
 		 556 aa  111  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00110  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.06 
 
 		 876 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.2 
 
 		 596 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  27.07 
 
 		 608 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.54 
 
 		 509 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.2 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  26.32 
 
 		 637 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.27 
 
 		 509 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.87 
 
 		 641 aa  110  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.94 
 
 		 626 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.54 
 
 		 509 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.54 
 
 		 509 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  25.2 
 
 		 632 aa  109  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.54 
 
 		 613 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.64 
 
 		 552 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38991  predicted protein  27.12 
 
 		 466 aa  110  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0505121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.77 
 
 		 624 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.22 
 
 		 607 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.96 
 
 		 607 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.58 
 
 		 608 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  27.52 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9529  predicted protein  28.73 
 
 		 348 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.88 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  26.06 
 
 		 639 aa  108  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.73 
 
 		 664 aa  108  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.53 
 
 		 639 aa  108  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  27.08 
 
 		 608 aa  108  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.37 
 
 		 607 aa  108  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.79 
 
 		 737 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.11 
 
 		 591 aa  107  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  26.5 
 
 		 669 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  25.31 
 
 		 698 aa  107  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.42 
 
 		 705 aa  107  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.92 
 
 		 790 aa  107  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.41 
 
 		 626 aa  107  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.64 
 
 		 736 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  26.39 
 
 		 636 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.22 
 
 		 592 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.21 
 
 		 607 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  28.49 
 
 		 535 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  27.25 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.91 
 
 		 656 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.63 
 
 		 633 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.26 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.05 
 
 		 611 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.25 
 
 		 637 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.57 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.63 
 
 		 607 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.36 
 
 		 602 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.25 
 
 		 596 aa  105  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  25.73 
 
 		 504 aa  105  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  27.7 
 
 		 1148 aa  105  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.78 
 
 		 707 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.19 
 
 		 731 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.69 
 
 		 658 aa  104  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.69 
 
 		 665 aa  105  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  26.42 
 
 		 630 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.76 
 
 		 607 aa  104  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.57 
 
 		 419 aa  104  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1034  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.68 
 
 		 506 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.21 
 
 		 607 aa  103  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>