More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3363 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3363  hypothetical protein  100 
 
 
1677 aa  3363    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.22 
 
 
630 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.77 
 
 
725 aa  239  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.75 
 
 
594 aa  238  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 
718 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 
634 aa  237  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.98 
 
 
736 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  38.77 
 
 
493 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.2 
 
 
724 aa  236  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  34.77 
 
 
1534 aa  235  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.16 
 
 
721 aa  234  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.36 
 
 
728 aa  233  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.01 
 
 
705 aa  233  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  36.92 
 
 
1148 aa  233  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.43 
 
 
705 aa  233  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  36.05 
 
 
637 aa  232  4e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.56 
 
 
592 aa  232  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.87 
 
 
707 aa  231  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.77 
 
 
706 aa  231  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.98 
 
 
737 aa  231  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
709 aa  231  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.01 
 
 
705 aa  231  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.11 
 
 
793 aa  231  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 
610 aa  230  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  39.08 
 
 
724 aa  230  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.1 
 
 
731 aa  230  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 
610 aa  230  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.24 
 
 
597 aa  229  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  32.22 
 
 
705 aa  229  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.34 
 
 
590 aa  229  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.83 
 
 
611 aa  229  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 
593 aa  229  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 
593 aa  229  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.18 
 
 
709 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.01 
 
 
705 aa  229  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.01 
 
 
705 aa  229  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.4 
 
 
588 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.16 
 
 
708 aa  228  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
617 aa  228  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
602 aa  228  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.94 
 
 
705 aa  228  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  32.01 
 
 
705 aa  228  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.47 
 
 
608 aa  227  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
647 aa  228  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 
626 aa  227  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 
617 aa  226  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
709 aa  227  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.59 
 
 
602 aa  226  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.17 
 
 
608 aa  226  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.8 
 
 
705 aa  225  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.8 
 
 
705 aa  225  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.8 
 
 
729 aa  225  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.87 
 
 
419 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.64 
 
 
607 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 
625 aa  224  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 
592 aa  224  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.91 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.43 
 
 
609 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.64 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
599 aa  224  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.57 
 
 
615 aa  224  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.75 
 
 
637 aa  224  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.64 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.84 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.88 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.57 
 
 
615 aa  224  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.39 
 
 
615 aa  223  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1831  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.35 
 
 
655 aa  223  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.84 
 
 
598 aa  223  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
681 aa  223  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.12 
 
 
722 aa  223  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.39 
 
 
615 aa  223  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.74 
 
 
620 aa  222  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39 
 
 
607 aa  222  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.4 
 
 
620 aa  222  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.58 
 
 
613 aa  221  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.11 
 
 
615 aa  221  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.24 
 
 
611 aa  221  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 
615 aa  221  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 
609 aa  221  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 
611 aa  221  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 
609 aa  221  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.6 
 
 
612 aa  221  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.07 
 
 
733 aa  221  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  37.24 
 
 
611 aa  221  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.72 
 
 
609 aa  221  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 
609 aa  221  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  37.24 
 
 
609 aa  221  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.91 
 
 
608 aa  220  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.09 
 
 
642 aa  220  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 
606 aa  220  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.17 
 
 
606 aa  220  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 
611 aa  220  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39 
 
 
707 aa  220  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.52 
 
 
488 aa  219  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.99 
 
 
614 aa  219  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.77 
 
 
712 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.78 
 
 
881 aa  219  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.71 
 
 
642 aa  219  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0089  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 
629 aa  219  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0181751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>