More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47969 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 1148 aa  2385    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  46.42 
 
 		 1534 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  42.86 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04400  ATP-dependent DNA helicase hus2/rqh1, putative  32.27 
 
 		 1054 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.58 
 
 		 647 aa  379  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  44.27 
 
 		 470 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.42 
 
 		 709 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.26 
 
 		 709 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.44 
 
 		 881 aa  367  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.76 
 
 		 714 aa  362  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 763 aa  361  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 647 aa  360  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 658 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 615 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 615 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 615 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 615 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 615 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.97 
 
 		 639 aa  359  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.75 
 
 		 644 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.22 
 
 		 615 aa  356  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.14 
 
 		 633 aa  354  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.86 
 
 		 633 aa  354  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.18 
 
 		 615 aa  353  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.49 
 
 		 615 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.38 
 
 		 731 aa  351  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.65 
 
 		 615 aa  351  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.28 
 
 		 625 aa  351  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.49 
 
 		 615 aa  350  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 615 aa  350  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 615 aa  350  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 615 aa  350  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.02 
 
 		 615 aa  349  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.69 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.39 
 
 		 617 aa  349  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.69 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.54 
 
 		 597 aa  348  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.03 
 
 		 657 aa  347  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.14 
 
 		 717 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.17 
 
 		 719 aa  347  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 		 736 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.77 
 
 		 615 aa  346  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  32.72 
 
 		 615 aa  345  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.69 
 
 		 630 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 605 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.79 
 
 		 674 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 		 601 aa  344  4e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.06 
 
 		 737 aa  344  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.35 
 
 		 618 aa  344  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  33.87 
 
 		 600 aa  344  5.999999999999999e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.28 
 
 		 626 aa  343  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 		 600 aa  343  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.88 
 
 		 718 aa  343  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.57 
 
 		 709 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34 
 
 		 612 aa  342  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.38 
 
 		 617 aa  343  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.43 
 
 		 615 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.08 
 
 		 623 aa  341  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.97 
 
 		 636 aa  340  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.39 
 
 		 607 aa  340  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.71 
 
 		 633 aa  340  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  34.57 
 
 		 601 aa  339  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  33.76 
 
 		 608 aa  339  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.66 
 
 		 711 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.57 
 
 		 619 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.11 
 
 		 693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.64 
 
 		 622 aa  338  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.02 
 
 		 608 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.38 
 
 		 607 aa  338  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 		 419 aa  337  5e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 		 722 aa  337  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.18 
 
 		 611 aa  337  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 620 aa  337  7.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.18 
 
 		 607 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.6 
 
 		 601 aa  337  9e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.02 
 
 		 614 aa  336  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.62 
 
 		 607 aa  336  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.72 
 
 		 709 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.49 
 
 		 637 aa  336  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.08 
 
 		 607 aa  335  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.81 
 
 		 739 aa  335  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.71 
 
 		 607 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.76 
 
 		 598 aa  335  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.81 
 
 		 596 aa  335  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.49 
 
 		 603 aa  335  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.88 
 
 		 705 aa  334  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.89 
 
 		 725 aa  334  7.000000000000001e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.57 
 
 		 603 aa  333  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  32.72 
 
 		 637 aa  333  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.66 
 
 		 608 aa  333  8e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  33.17 
 
 		 608 aa  333  9e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.08 
 
 		 607 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.52 
 
 		 659 aa  333  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.08 
 
 		 607 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.08 
 
 		 607 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.08 
 
 		 607 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.77 
 
 		 608 aa  333  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.92 
 
 		 625 aa  333  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.56 
 
 		 607 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.56 
 
 		 607 aa  333  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>