More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18280 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  100 
 
 
504 aa  1058    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  42.86 
 
 
1148 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  41.5 
 
 
1534 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  41.87 
 
 
470 aa  355  8.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.2 
 
 
718 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 
731 aa  352  8.999999999999999e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.65 
 
 
709 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
647 aa  346  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.45 
 
 
709 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.25 
 
 
709 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.71 
 
 
606 aa  336  5e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.23 
 
 
603 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 
707 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.87 
 
 
725 aa  329  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38991  predicted protein  44.39 
 
 
466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0505121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 
617 aa  324  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.18 
 
 
606 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.41 
 
 
599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.38 
 
 
737 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.92 
 
 
611 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38 
 
 
599 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.02 
 
 
733 aa  319  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 
736 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.53 
 
 
611 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.53 
 
 
611 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.45 
 
 
601 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.37 
 
 
722 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.7 
 
 
881 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.42 
 
 
719 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  41.57 
 
 
724 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.01 
 
 
714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  35.98 
 
 
493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  40.55 
 
 
734 aa  314  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  37.73 
 
 
698 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.03 
 
 
725 aa  313  4.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  38.08 
 
 
628 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
707 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.53 
 
 
715 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.55 
 
 
615 aa  312  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 
633 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.96 
 
 
605 aa  312  9e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.45 
 
 
607 aa  312  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 
639 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.83 
 
 
601 aa  309  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.11 
 
 
596 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.26 
 
 
707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.45 
 
 
615 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.61 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.18 
 
 
614 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.89 
 
 
598 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.12 
 
 
625 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.33 
 
 
609 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.31 
 
 
729 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.03 
 
 
607 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.87 
 
 
612 aa  306  8.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
607 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 
607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.03 
 
 
620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.3 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
607 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.03 
 
 
611 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.23 
 
 
729 aa  304  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.4 
 
 
611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.93 
 
 
623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.12 
 
 
624 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  35.92 
 
 
705 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.04 
 
 
599 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.18 
 
 
613 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.47 
 
 
607 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.2 
 
 
611 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.2 
 
 
611 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.2 
 
 
609 aa  302  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.2 
 
 
609 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 
711 aa  302  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.15 
 
 
779 aa  302  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  35.71 
 
 
705 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00110  ATP-dependent DNA helicase, putative  37.14 
 
 
876 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368414  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.71 
 
 
600 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 
705 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.92 
 
 
705 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  37.04 
 
 
600 aa  302  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.2 
 
 
609 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  37.2 
 
 
609 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.49 
 
 
712 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  37.2 
 
 
611 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 
633 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.93 
 
 
606 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.8 
 
 
615 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.99 
 
 
609 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.49 
 
 
711 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.8 
 
 
615 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.94 
 
 
705 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.69 
 
 
633 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 
419 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.77 
 
 
710 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.95 
 
 
626 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.95 
 
 
599 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.67 
 
 
662 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.8 
 
 
615 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>