More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33966 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  100 
 
 
470 aa  989    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  42.77 
 
 
1534 aa  382  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  44.27 
 
 
1148 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  41.87 
 
 
504 aa  355  7.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 
709 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.74 
 
 
605 aa  329  8e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 
709 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.49 
 
 
709 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 
881 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.51 
 
 
731 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.84 
 
 
612 aa  323  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.61 
 
 
736 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.04 
 
 
718 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.14 
 
 
737 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.95 
 
 
606 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38991  predicted protein  41.84 
 
 
466 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0505121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.04 
 
 
647 aa  316  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 
603 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.72 
 
 
714 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  40.84 
 
 
493 aa  311  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.82 
 
 
606 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.41 
 
 
733 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.51 
 
 
710 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.91 
 
 
712 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.91 
 
 
711 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.93 
 
 
617 aa  305  8.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 
707 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.81 
 
 
725 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
625 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.8 
 
 
779 aa  303  6.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.16 
 
 
709 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.27 
 
 
601 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.84 
 
 
610 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 
451 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.84 
 
 
610 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.89 
 
 
597 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
719 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.58 
 
 
615 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.33 
 
 
599 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
707 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
599 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.8 
 
 
714 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.88 
 
 
615 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
658 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
615 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
647 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
615 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
615 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
615 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.86 
 
 
625 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.66 
 
 
711 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
763 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 
705 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
644 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.89 
 
 
609 aa  296  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.04 
 
 
602 aa  295  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.8 
 
 
715 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.72 
 
 
607 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.47 
 
 
611 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.38 
 
 
729 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.8 
 
 
715 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.91 
 
 
599 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
611 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
609 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
609 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
611 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
609 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.8 
 
 
715 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.41 
 
 
615 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.71 
 
 
611 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.71 
 
 
611 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  40.24 
 
 
609 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14845  predicted protein  40.52 
 
 
440 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
717 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  40.24 
 
 
611 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  38.27 
 
 
608 aa  293  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 
709 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.72 
 
 
613 aa  293  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  38.27 
 
 
709 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  39.06 
 
 
734 aa  292  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.06 
 
 
611 aa  292  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.02 
 
 
611 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  39.86 
 
 
698 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  38.27 
 
 
608 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.84 
 
 
729 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.24 
 
 
605 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  40.56 
 
 
615 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.19 
 
 
601 aa  290  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.02 
 
 
600 aa  290  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  39.02 
 
 
600 aa  290  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.58 
 
 
615 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.43 
 
 
626 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  40.19 
 
 
601 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>