More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38991 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38991  predicted protein  100 
 
 
466 aa  964    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0505121 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  44.39 
 
 
504 aa  341  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  43.56 
 
 
1534 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  41.84 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.6 
 
 
607 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.99 
 
 
608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  41.69 
 
 
1148 aa  327  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 
607 aa  326  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.93 
 
 
596 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.99 
 
 
607 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.47 
 
 
607 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.23 
 
 
607 aa  322  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.99 
 
 
607 aa  322  8e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 
607 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.09 
 
 
613 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.19 
 
 
601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.47 
 
 
607 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.47 
 
 
607 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.52 
 
 
709 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.26 
 
 
709 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.47 
 
 
607 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.47 
 
 
607 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
709 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.23 
 
 
610 aa  319  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.56 
 
 
714 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.36 
 
 
647 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 
607 aa  317  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.23 
 
 
603 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 
715 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.03 
 
 
615 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.23 
 
 
601 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  44.23 
 
 
601 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 
705 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 
633 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.88 
 
 
718 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.29 
 
 
657 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.84 
 
 
731 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.49 
 
 
639 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  42.24 
 
 
608 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.6 
 
 
717 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.34 
 
 
612 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42 
 
 
790 aa  304  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.49 
 
 
610 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.49 
 
 
610 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  42.24 
 
 
608 aa  303  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.49 
 
 
597 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.12 
 
 
737 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.82 
 
 
612 aa  303  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 
881 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.13 
 
 
599 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 
599 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.4 
 
 
606 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.89 
 
 
611 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.89 
 
 
611 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.42 
 
 
611 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 
615 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  41.35 
 
 
611 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 
618 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  41.35 
 
 
609 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.35 
 
 
611 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
611 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 
615 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 
615 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
609 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
609 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
609 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.31 
 
 
711 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 
615 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 
712 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
611 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
609 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.59 
 
 
615 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
602 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.62 
 
 
599 aa  295  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  39.95 
 
 
698 aa  296  8e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 
608 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.82 
 
 
626 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.77 
 
 
606 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 
633 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
609 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.05 
 
 
605 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.89 
 
 
705 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.35 
 
 
707 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.86 
 
 
736 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.79 
 
 
622 aa  293  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.29 
 
 
624 aa  292  7e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 
605 aa  293  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
615 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
614 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
615 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 
608 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.81 
 
 
615 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
615 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
615 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
615 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42 
 
 
714 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.11 
 
 
609 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
615 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.16 
 
 
763 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 
658 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>