More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00110 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND00110  ATP-dependent DNA helicase, putative  100 
 
 		 876 aa  1807    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368414  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14845  predicted protein  44.92 
 
 		 440 aa  309  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  37.27 
 
 		 504 aa  303  9e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  33.65 
 
 		 1148 aa  300  9e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  35.64 
 
 		 1534 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.33 
 
 		 633 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.38 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  38.66 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.06 
 
 		 610 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.87 
 
 		 623 aa  281  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.91 
 
 		 639 aa  281  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.56 
 
 		 618 aa  277  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.32 
 
 		 602 aa  273  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.7 
 
 		 677 aa  273  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.08 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.08 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.52 
 
 		 705 aa  270  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 		 622 aa  270  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.65 
 
 		 636 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  32.97 
 
 		 608 aa  269  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.7 
 
 		 607 aa  269  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.05 
 
 		 711 aa  268  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38 
 
 		 731 aa  268  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.94 
 
 		 707 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  33.27 
 
 		 698 aa  267  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  37.25 
 
 		 637 aa  266  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  32.73 
 
 		 608 aa  266  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38991  predicted protein  37.67 
 
 		 466 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0505121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.04 
 
 		 711 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.78 
 
 		 623 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.69 
 
 		 615 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.15 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.22 
 
 		 615 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.12 
 
 		 607 aa  266  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.25 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 		 779 aa  265  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.91 
 
 		 644 aa  263  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.62 
 
 		 613 aa  263  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.74 
 
 		 615 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.44 
 
 		 615 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 763 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.44 
 
 		 615 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 647 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.56 
 
 		 615 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 		 615 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 		 615 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 		 615 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 658 aa  262  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 615 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 615 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 615 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 615 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.47 
 
 		 712 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.67 
 
 		 607 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.3 
 
 		 607 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.07 
 
 		 608 aa  261  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.58 
 
 		 607 aa  261  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.8 
 
 		 630 aa  260  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.14 
 
 		 717 aa  260  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.14 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.58 
 
 		 607 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.58 
 
 		 607 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.58 
 
 		 607 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.56 
 
 		 710 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 		 611 aa  259  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.04 
 
 		 607 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.3 
 
 		 607 aa  258  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.01 
 
 		 603 aa  258  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2194  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.01 
 
 		 603 aa  258  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.4 
 
 		 599 aa  257  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.49 
 
 		 611 aa  257  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.54 
 
 		 715 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.53 
 
 		 705 aa  257  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.73 
 
 		 714 aa  257  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.04 
 
 		 607 aa  257  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.42 
 
 		 616 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 707 aa  256  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.09 
 
 		 615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.83 
 
 		 615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.35 
 
 		 715 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.64 
 
 		 607 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.76 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.53 
 
 		 626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.27 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.49 
 
 		 615 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 		 609 aa  255  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 		 609 aa  255  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.14 
 
 		 605 aa  255  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 		 609 aa  255  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  35.27 
 
 		 611 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 609 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  35.27 
 
 		 609 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.49 
 
 		 615 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.49 
 
 		 615 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.49 
 
 		 615 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.16 
 
 		 715 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.1 
 
 		 725 aa  254  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 		 736 aa  254  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.48 
 
 		 659 aa  254  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>