More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04400 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC04400  ATP-dependent DNA helicase hus2/rqh1, putative  100 
 
 
1054 aa  2199    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273151  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  36.04 
 
 
1148 aa  382  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  38.84 
 
 
1534 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  36.67 
 
 
470 aa  281  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  34.62 
 
 
504 aa  275  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
647 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.34 
 
 
625 aa  243  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.15 
 
 
617 aa  240  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.23 
 
 
709 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.32 
 
 
709 aa  237  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.12 
 
 
709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.79 
 
 
714 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14845  predicted protein  40.5 
 
 
440 aa  234  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
633 aa  233  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.25 
 
 
615 aa  231  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.05 
 
 
674 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  34.87 
 
 
724 aa  231  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38991  predicted protein  36.65 
 
 
466 aa  230  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0505121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.07 
 
 
731 aa  230  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.08 
 
 
790 aa  229  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.07 
 
 
613 aa  228  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 
596 aa  227  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.89 
 
 
630 aa  227  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  31.2 
 
 
608 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.03 
 
 
611 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.88 
 
 
599 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.4 
 
 
718 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
763 aa  226  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
881 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.53 
 
 
599 aa  225  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.55 
 
 
681 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  31.02 
 
 
608 aa  224  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.81 
 
 
601 aa  224  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.91 
 
 
624 aa  224  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
658 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
647 aa  224  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.32 
 
 
731 aa  224  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.42 
 
 
607 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
615 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
615 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.33 
 
 
620 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.9 
 
 
715 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.42 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.36 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.28 
 
 
612 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.42 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.42 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
615 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
615 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.51 
 
 
679 aa  222  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.47 
 
 
644 aa  222  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.73 
 
 
707 aa  221  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.5 
 
 
601 aa  221  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.65 
 
 
633 aa  221  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.05 
 
 
619 aa  221  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.41 
 
 
737 aa  221  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.97 
 
 
607 aa  221  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.48 
 
 
623 aa  221  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.66 
 
 
705 aa  220  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.22 
 
 
639 aa  220  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.38 
 
 
603 aa  219  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.19 
 
 
615 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.55 
 
 
602 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 
615 aa  219  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.06 
 
 
615 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  38.63 
 
 
601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.98 
 
 
597 aa  219  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.83 
 
 
610 aa  218  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.83 
 
 
610 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.62 
 
 
729 aa  218  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.76 
 
 
599 aa  217  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.11 
 
 
623 aa  217  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.22 
 
 
621 aa  217  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.03 
 
 
712 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.85 
 
 
607 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.77 
 
 
607 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  30.06 
 
 
734 aa  216  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  32 
 
 
698 aa  216  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.99 
 
 
607 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_006686  CND00110  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.34 
 
 
876 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.46 
 
 
615 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.44 
 
 
717 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.2 
 
 
711 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.26 
 
 
615 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.99 
 
 
607 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.82 
 
 
607 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.26 
 
 
615 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.59 
 
 
615 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  32.79 
 
 
615 aa  214  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.99 
 
 
625 aa  214  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.73 
 
 
622 aa  214  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.95 
 
 
605 aa  214  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.4 
 
 
608 aa  214  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.4 
 
 
659 aa  214  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  35.81 
 
 
681 aa  214  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.69 
 
 
729 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  31.54 
 
 
637 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.26 
 
 
615 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.55 
 
 
615 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.26 
 
 
615 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>