More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3200 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.87 
 
 		 588 aa  737    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 600 aa  1204    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.39 
 
 		 593 aa  738    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.93 
 
 		 607 aa  545  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.17 
 
 		 719 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.27 
 
 		 598 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.49 
 
 		 611 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.84 
 
 		 633 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.67 
 
 		 598 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.49 
 
 		 657 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.75 
 
 		 612 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.31 
 
 		 601 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.59 
 
 		 625 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 600 aa  522  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  47.49 
 
 		 600 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.8 
 
 		 625 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.5 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.25 
 
 		 616 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.1 
 
 		 709 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  47.36 
 
 		 709 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.81 
 
 		 617 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.3 
 
 		 709 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.41 
 
 		 633 aa  515  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  49.33 
 
 		 618 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.5 
 
 		 630 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.63 
 
 		 611 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.63 
 
 		 611 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.22 
 
 		 714 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.58 
 
 		 619 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.37 
 
 		 626 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.15 
 
 		 600 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.74 
 
 		 599 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 658 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.63 
 
 		 715 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 647 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.84 
 
 		 693 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.23 
 
 		 644 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 763 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.63 
 
 		 715 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.54 
 
 		 712 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.78 
 
 		 707 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.46 
 
 		 715 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.75 
 
 		 615 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.38 
 
 		 615 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.22 
 
 		 615 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.59 
 
 		 615 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.1 
 
 		 710 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.24 
 
 		 615 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.45 
 
 		 711 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 		 615 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 		 615 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 		 615 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.01 
 
 		 662 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.28 
 
 		 639 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.5 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.66 
 
 		 601 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.42 
 
 		 621 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.61 
 
 		 618 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.63 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.84 
 
 		 625 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  47.33 
 
 		 628 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.42 
 
 		 613 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5464  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.16 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.78 
 
 		 615 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.05 
 
 		 622 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3336  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.76 
 
 		 616 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.87 
 
 		 603 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.34 
 
 		 617 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.46 
 
 		 714 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  46.62 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.24 
 
 		 615 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 617 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.07 
 
 		 609 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.91 
 
 		 739 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.31 
 
 		 748 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.44 
 
 		 659 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.02 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.65 
 
 		 636 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.24 
 
 		 647 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.41 
 
 		 637 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.24 
 
 		 618 aa  485  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 		 605 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17970  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.75 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.510597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0108  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.16 
 
 		 595 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179764  normal  0.109981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.62 
 
 		 606 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  42.48 
 
 		 608 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 		 620 aa  482  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.45 
 
 		 623 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.95 
 
 		 623 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  41.98 
 
 		 608 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.92 
 
 		 607 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 611 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 		 677 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.52 
 
 		 603 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.5 
 
 		 607 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>