More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2335 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.82 
 
 		 600 aa  764    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.5 
 
 		 588 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 593 aa  1182    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.92 
 
 		 607 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.18 
 
 		 633 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.42 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.51 
 
 		 598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 		 622 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.68 
 
 		 621 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.36 
 
 		 719 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.57 
 
 		 625 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.83 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.9 
 
 		 600 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.31 
 
 		 599 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.55 
 
 		 597 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 		 610 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 		 610 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.34 
 
 		 625 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  45.64 
 
 		 600 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.71 
 
 		 601 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.03 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.81 
 
 		 600 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.79 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.98 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 		 599 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  44.28 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  44.22 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.53 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.21 
 
 		 626 aa  495  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.63 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 616 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.8 
 
 		 608 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 607 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.24 
 
 		 602 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.26 
 
 		 610 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.99 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.05 
 
 		 614 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.99 
 
 		 618 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.53 
 
 		 609 aa  490  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.12 
 
 		 611 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.48 
 
 		 603 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 		 609 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 		 607 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.67 
 
 		 601 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 		 609 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  46.58 
 
 		 618 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 		 611 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.12 
 
 		 607 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.37 
 
 		 620 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.12 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  43.95 
 
 		 611 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.03 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2194  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 603 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.22 
 
 		 611 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 603 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.43 
 
 		 607 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.83 
 
 		 607 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.26 
 
 		 607 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.18 
 
 		 611 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.18 
 
 		 611 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  43.95 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.4 
 
 		 647 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.12 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.95 
 
 		 611 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.43 
 
 		 607 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.46 
 
 		 710 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 		 624 aa  482  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.43 
 
 		 607 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.78 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.89 
 
 		 608 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.66 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 615 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.76 
 
 		 709 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 615 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 709 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.02 
 
 		 709 aa  482  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.01 
 
 		 619 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 615 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 615 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.44 
 
 		 599 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.82 
 
 		 617 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.08 
 
 		 615 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.3 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 647 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.84 
 
 		 615 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 		 644 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 658 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 		 615 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.65 
 
 		 603 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.82 
 
 		 630 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 		 615 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 		 615 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.37 
 
 		 715 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 		 615 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 		 615 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.47 
 
 		 790 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 763 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 		 615 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.55 
 
 		 679 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>