More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1914 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.36 
 
 		 600 aa  743    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.5 
 
 		 593 aa  683    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 588 aa  1180    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.41 
 
 		 711 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.67 
 
 		 611 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.42 
 
 		 719 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.66 
 
 		 633 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.16 
 
 		 607 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.68 
 
 		 598 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.92 
 
 		 599 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.92 
 
 		 621 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  47.54 
 
 		 600 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.93 
 
 		 622 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.34 
 
 		 626 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.85 
 
 		 618 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.2 
 
 		 600 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  46.63 
 
 		 608 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.91 
 
 		 609 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.42 
 
 		 657 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.49 
 
 		 600 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.25 
 
 		 625 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.91 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  46.39 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.09 
 
 		 611 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.09 
 
 		 611 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.71 
 
 		 612 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.81 
 
 		 617 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.04 
 
 		 598 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 		 601 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.38 
 
 		 709 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.84 
 
 		 619 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.05 
 
 		 625 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.81 
 
 		 601 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.71 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.39 
 
 		 616 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.51 
 
 		 601 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 617 aa  501  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.41 
 
 		 603 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.92 
 
 		 748 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.86 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.28 
 
 		 647 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  46.95 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 		 715 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  47.91 
 
 		 628 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  47.49 
 
 		 618 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  45.64 
 
 		 601 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.7 
 
 		 712 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.45 
 
 		 715 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.15 
 
 		 602 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 		 647 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.52 
 
 		 711 aa  492  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.15 
 
 		 633 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.54 
 
 		 644 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 		 662 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.48 
 
 		 714 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.19 
 
 		 707 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.09 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.53 
 
 		 639 aa  492  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 		 658 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.38 
 
 		 763 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.23 
 
 		 606 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 615 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 		 599 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.9 
 
 		 715 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 615 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.19 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 615 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 615 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.9 
 
 		 715 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 615 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 		 714 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 615 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.69 
 
 		 617 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.07 
 
 		 608 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.03 
 
 		 610 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.74 
 
 		 599 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.03 
 
 		 610 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.57 
 
 		 615 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.11 
 
 		 739 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.78 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.67 
 
 		 710 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.81 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.03 
 
 		 597 aa  485  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.19 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 		 608 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5464  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.81 
 
 		 605 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195323  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.97 
 
 		 611 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.93 
 
 		 620 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  43.63 
 
 		 609 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.97 
 
 		 611 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.74 
 
 		 615 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 		 633 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.37 
 
 		 615 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.8 
 
 		 611 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.5 
 
 		 599 aa  480  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>