232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0901 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 737 aa  1505    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 729 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  30.43 
 
 		 762 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  35.48 
 
 		 750 aa  203  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  27.48 
 
 		 783 aa  197  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 		 781 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26.01 
 
 		 779 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  24.92 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  27.79 
 
 		 741 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  28.15 
 
 		 750 aa  177  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  28.34 
 
 		 795 aa  170  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  29.35 
 
 		 744 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  29.5 
 
 		 775 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 		 763 aa  160  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  32.84 
 
 		 764 aa  156  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  28.08 
 
 		 729 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  28.23 
 
 		 791 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  31.29 
 
 		 741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  24.92 
 
 		 1027 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.44 
 
 		 801 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  29.8 
 
 		 823 aa  145  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.89 
 
 		 736 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  29.98 
 
 		 726 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  25.51 
 
 		 887 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  25.16 
 
 		 899 aa  141  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  28.25 
 
 		 901 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  26.11 
 
 		 921 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.44 
 
 		 885 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 860 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  29.49 
 
 		 922 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  23.89 
 
 		 811 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  23 
 
 		 912 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  22 
 
 		 968 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  28.69 
 
 		 888 aa  134  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.9 
 
 		 1540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.51 
 
 		 970 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  24.89 
 
 		 906 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  30.23 
 
 		 594 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.17 
 
 		 905 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  29.44 
 
 		 888 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  29.05 
 
 		 888 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  23.6 
 
 		 944 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  30.91 
 
 		 948 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.13 
 
 		 837 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  24.17 
 
 		 883 aa  127  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  23.72 
 
 		 965 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  24.63 
 
 		 908 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22 
 
 		 962 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  25.55 
 
 		 907 aa  124  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.57 
 
 		 920 aa  124  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  28.79 
 
 		 778 aa  124  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  26.46 
 
 		 871 aa  124  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  26.79 
 
 		 854 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  24.78 
 
 		 887 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  25.53 
 
 		 765 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  24.84 
 
 		 887 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  26.18 
 
 		 800 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  24.29 
 
 		 904 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  26.34 
 
 		 827 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 		 927 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  24.24 
 
 		 899 aa  115  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  22.26 
 
 		 929 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  23.32 
 
 		 912 aa  114  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.65 
 
 		 917 aa  113  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  23.45 
 
 		 919 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.57 
 
 		 971 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  21.92 
 
 		 860 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  26.18 
 
 		 897 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.01 
 
 		 892 aa  111  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.22 
 
 		 721 aa  110  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.44 
 
 		 897 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  23.1 
 
 		 897 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.07 
 
 		 885 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  25.2 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.22 
 
 		 944 aa  107  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  25.48 
 
 		 807 aa  106  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  26.84 
 
 		 854 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  25.71 
 
 		 899 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.99 
 
 		 733 aa  105  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  23.53 
 
 		 701 aa  104  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  22.01 
 
 		 986 aa  104  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  24.14 
 
 		 899 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  21.52 
 
 		 943 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.61 
 
 		 724 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  24.84 
 
 		 885 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  21.83 
 
 		 857 aa  100  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  23.76 
 
 		 892 aa  100  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  24.7 
 
 		 933 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  23.52 
 
 		 915 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  23.81 
 
 		 868 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  21.83 
 
 		 832 aa  98.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  22.27 
 
 		 871 aa  97.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  24.94 
 
 		 918 aa  95.5  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  22.96 
 
 		 739 aa  94.7  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  29.58 
 
 		 836 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 		 908 aa  94.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  21.53 
 
 		 881 aa  94  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.04 
 
 		 776 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  23.76 
 
 		 876 aa  92.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 780 aa  91.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>