167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1777 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
970 aa  1975    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 
790 aa  72.4  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.41 
 
 
876 aa  72.4  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.91 
 
 
762 aa  71.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.32 
 
 
739 aa  67.8  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.93 
 
 
764 aa  67  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  28.57 
 
 
815 aa  65.1  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.66 
 
 
911 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.32 
 
 
941 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.43 
 
 
768 aa  62  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.61 
 
 
896 aa  61.6  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  25.52 
 
 
1210 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  26.6 
 
 
761 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.29 
 
 
959 aa  60.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  25.95 
 
 
751 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.43 
 
 
685 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.87 
 
 
807 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
738 aa  57.4  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  26.15 
 
 
758 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.58 
 
 
773 aa  57.4  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24 
 
 
789 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.2 
 
 
803 aa  56.2  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.8 
 
 
740 aa  55.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.04 
 
 
815 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.2 
 
 
815 aa  55.1  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.4 
 
 
711 aa  54.7  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 
763 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.06 
 
 
764 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  24 
 
 
912 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.34 
 
 
716 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.2 
 
 
802 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.99 
 
 
764 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  27.13 
 
 
798 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.43 
 
 
752 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.67 
 
 
744 aa  53.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 
778 aa  52.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  30.16 
 
 
701 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  30.16 
 
 
701 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.58 
 
 
753 aa  53.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  27.89 
 
 
1321 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  26.06 
 
 
764 aa  52  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.23 
 
 
740 aa  52  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.23 
 
 
818 aa  51.6  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  27.54 
 
 
746 aa  52  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0248  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.63 
 
 
428 aa  52  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.12 
 
 
824 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  33.33 
 
 
726 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.06 
 
 
696 aa  51.6  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.93 
 
 
962 aa  51.6  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.61 
 
 
744 aa  51.6  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.99 
 
 
756 aa  51.6  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  29.93 
 
 
751 aa  51.6  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  25.14 
 
 
804 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.51 
 
 
811 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  26.7 
 
 
797 aa  51.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.14 
 
 
868 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.51 
 
 
811 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.86 
 
 
807 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.69 
 
 
811 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.29 
 
 
879 aa  51.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.64 
 
 
744 aa  51.2  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  28.19 
 
 
1838 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.29 
 
 
708 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.97 
 
 
433 aa  50.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
425 aa  50.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.08 
 
 
744 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  29.21 
 
 
707 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  41.38 
 
 
799 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.94 
 
 
890 aa  49.3  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  20.93 
 
 
758 aa  49.7  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  28.42 
 
 
2087 aa  49.7  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2544  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.82 
 
 
680 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.711022  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.56 
 
 
764 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.51 
 
 
751 aa  49.7  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.88 
 
 
815 aa  49.3  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.11 
 
 
592 aa  49.3  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.64 
 
 
751 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.76 
 
 
701 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  25.42 
 
 
862 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0592  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.57 
 
 
1458 aa  48.9  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.233489 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  24.26 
 
 
1385 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.44 
 
 
739 aa  48.9  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  23.08 
 
 
931 aa  48.9  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.72 
 
 
806 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.28 
 
 
403 aa  48.5  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  28.12 
 
 
2224 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  27.03 
 
 
452 aa  48.5  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  22.63 
 
 
1704 aa  48.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.68 
 
 
810 aa  48.5  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.08 
 
 
474 aa  48.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.24 
 
 
761 aa  48.1  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.28 
 
 
759 aa  47.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  33.77 
 
 
843 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  31.21 
 
 
753 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.56 
 
 
914 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.39 
 
 
1534 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.7 
 
 
838 aa  47.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.62 
 
 
808 aa  47.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  41.38 
 
 
488 aa  47.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.15 
 
 
972 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>