More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1390 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
433 aa  885    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0526  superfamily II DNA/RNA helicase  45.45 
 
 
431 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0569  superfamily II DNA/RNA helicase  36.46 
 
 
435 aa  240  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0487433 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1239  superfamily II DNA/RNA helicase  36.26 
 
 
360 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.604047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.25 
 
 
389 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2189  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000387501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2119  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00322854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1961  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1940  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.218077  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000776254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2143  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.77 
 
 
457 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1916  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.25 
 
 
389 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3195  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.95 
 
 
389 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0825  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.8 
 
 
360 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.760801  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.05 
 
 
536 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.92 
 
 
595 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.5 
 
 
557 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
498 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.5 
 
 
557 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.5 
 
 
557 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.15 
 
 
543 aa  204  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.93 
 
 
389 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000478043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  36.55 
 
 
495 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.88 
 
 
621 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.2 
 
 
624 aa  200  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  34.32 
 
 
530 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.14 
 
 
564 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.28 
 
 
655 aa  199  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.77 
 
 
664 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.06 
 
 
594 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  37.04 
 
 
513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.83 
 
 
550 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.77 
 
 
664 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
625 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.58 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.96 
 
 
532 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.77 
 
 
664 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
632 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.71 
 
 
546 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  35 
 
 
629 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35 
 
 
629 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
651 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
651 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  35.24 
 
 
656 aa  196  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  35 
 
 
629 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
651 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 
513 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1852  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
438 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  35.09 
 
 
563 aa  196  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.82 
 
 
617 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.82 
 
 
617 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.43 
 
 
589 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  37.2 
 
 
422 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  34.43 
 
 
589 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  30.86 
 
 
460 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.71 
 
 
653 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.29 
 
 
415 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.71 
 
 
546 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.76 
 
 
589 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  34.81 
 
 
591 aa  194  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  34.67 
 
 
528 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.4 
 
 
646 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35 
 
 
629 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.67 
 
 
538 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.59 
 
 
607 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  35.93 
 
 
579 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
622 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
622 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.94 
 
 
565 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
529 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.33 
 
 
485 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.17 
 
 
481 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.84 
 
 
590 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1497  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.18 
 
 
405 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.333515  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.33 
 
 
485 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
619 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.14 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  35.4 
 
 
640 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.58 
 
 
602 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001496  ATP-dependent RNA helicase  32.26 
 
 
416 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16101  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  35.4 
 
 
609 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.4 
 
 
609 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.42 
 
 
530 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1768  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.18 
 
 
405 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.57 
 
 
541 aa  190  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.83 
 
 
643 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  35.09 
 
 
601 aa  190  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.31 
 
 
640 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3140  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.86 
 
 
475 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.31 
 
 
640 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>