More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1239 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1239  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 
360 aa  730    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.604047  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0825  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  78.61 
 
 
360 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.760801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000478043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1961  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.09 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1940  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.09 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.218077  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.09 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.09 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000776254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2143  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.09 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2119  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.09 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00322854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2189  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.09 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000387501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1916  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.09 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3195  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.81 
 
 
389 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.26 
 
 
389 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.26 
 
 
433 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0526  superfamily II DNA/RNA helicase  34.14 
 
 
431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.21 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.164843  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.31 
 
 
622 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.02 
 
 
619 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.02 
 
 
622 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
594 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.33 
 
 
541 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.6 
 
 
546 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.31 
 
 
623 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.33 
 
 
546 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.95 
 
 
599 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.93 
 
 
637 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
623 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.93 
 
 
610 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.93 
 
 
634 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4187  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.59 
 
 
436 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4025  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.59 
 
 
436 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4307  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.59 
 
 
436 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.163670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4035  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.59 
 
 
436 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000492575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.04 
 
 
605 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.59 
 
 
436 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000163692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4366  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.59 
 
 
436 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000110703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4419  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.59 
 
 
436 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000144636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.1 
 
 
527 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.04 
 
 
669 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0569  superfamily II DNA/RNA helicase  31.16 
 
 
435 aa  187  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0487433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
640 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.72 
 
 
640 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.72 
 
 
640 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.72 
 
 
640 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
640 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4403  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.31 
 
 
436 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000107871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.99 
 
 
643 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0833  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.31 
 
 
436 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  hitchhiker  0.0000000000789178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.52 
 
 
530 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.04 
 
 
611 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1768  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.24 
 
 
405 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.51 
 
 
538 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  32.39 
 
 
581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.32 
 
 
632 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.24 
 
 
657 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  34.59 
 
 
579 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1497  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.24 
 
 
405 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.333515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.31 
 
 
532 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0211  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.06 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.04 
 
 
625 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.84 
 
 
651 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.84 
 
 
651 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.84 
 
 
651 aa  182  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.05 
 
 
624 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  31.84 
 
 
629 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.84 
 
 
629 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.31 
 
 
436 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  31.84 
 
 
629 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.84 
 
 
629 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.51 
 
 
621 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.84 
 
 
629 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.95 
 
 
584 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3013  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 
436 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.84 
 
 
629 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  34.01 
 
 
589 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  32.09 
 
 
591 aa  182  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1726  RNA helicase DeaD  30.03 
 
 
611 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2734  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.22 
 
 
652 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1225  DEAD/DEAH box helicase  32.22 
 
 
628 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.75882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2640  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.22 
 
 
651 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0124  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.58 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  31.69 
 
 
640 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.42 
 
 
590 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.87 
 
 
565 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.93 
 
 
509 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  30.6 
 
 
469 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.78 
 
 
505 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.56 
 
 
629 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.56 
 
 
629 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.56 
 
 
629 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  30.46 
 
 
476 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.56 
 
 
629 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.84 
 
 
653 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0248  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.45 
 
 
428 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11921  putative ATP-dependent RNA helicase  32.42 
 
 
595 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1852  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.15 
 
 
438 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3140  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.22 
 
 
475 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  31.44 
 
 
601 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.56 
 
 
629 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
506 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>