More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3140 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3140  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
475 aa  954    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1852  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.65 
 
 
438 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 
443 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.164843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0124  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.28 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0211  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.77 
 
 
383 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1768  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.12 
 
 
405 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1497  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.12 
 
 
405 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.333515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.5 
 
 
389 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000478043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
389 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2119  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.42 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00322854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.42 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000776254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1961  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.42 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1940  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.42 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.218077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2143  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.42 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.42 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1916  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.42 
 
 
389 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2189  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.15 
 
 
389 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000387501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3195  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.88 
 
 
389 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.31 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.86 
 
 
515 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
525 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
526 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
525 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.63 
 
 
589 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.23 
 
 
405 aa  209  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3227  predicted protein  34.53 
 
 
416 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0464388  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.55 
 
 
467 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.69 
 
 
485 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.69 
 
 
485 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.77 
 
 
513 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.67 
 
 
491 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
653 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.72 
 
 
535 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.24 
 
 
511 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.5 
 
 
466 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.97 
 
 
511 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  32.77 
 
 
460 aa  203  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
624 aa  203  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.16 
 
 
549 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
629 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  34.51 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.51 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.86 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.86 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.86 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  34.86 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.87 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.92 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  34.86 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.86 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.47 
 
 
539 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.86 
 
 
538 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.86 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  34.51 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.22 
 
 
651 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.22 
 
 
651 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  34.86 
 
 
528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.5 
 
 
614 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.22 
 
 
651 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 
528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.989648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.51 
 
 
629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  34.86 
 
 
529 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.66 
 
 
498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.69 
 
 
625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.27 
 
 
496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3791  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.81 
 
 
445 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.138512  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.77 
 
 
550 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.55 
 
 
494 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.24 
 
 
629 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.98 
 
 
549 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.13 
 
 
477 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1587  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.74 
 
 
453 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.27 
 
 
443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.42 
 
 
621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  33.9 
 
 
527 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  33.62 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.99 
 
 
513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.7 
 
 
632 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.99 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0855  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.3 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.521199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0847  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.3 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.348098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.69 
 
 
655 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.26 
 
 
451 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
618 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  31.81 
 
 
485 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.08 
 
 
482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.94 
 
 
546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.75 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.76 
 
 
590 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.42 
 
 
664 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  33.99 
 
 
435 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.18 
 
 
637 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  33.8 
 
 
513 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>