More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0642 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
513 aa  1043    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.4 
 
 
513 aa  830    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  66.39 
 
 
495 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.05 
 
 
485 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.05 
 
 
485 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.85 
 
 
457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.47 
 
 
584 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.58 
 
 
530 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.39 
 
 
550 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.92 
 
 
532 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  45.15 
 
 
656 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.98 
 
 
570 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  46.26 
 
 
589 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.4 
 
 
632 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  48.15 
 
 
595 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.17 
 
 
539 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  46.84 
 
 
579 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.86 
 
 
590 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.52 
 
 
561 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.86 
 
 
589 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.26 
 
 
599 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.24 
 
 
606 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.84 
 
 
531 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.08 
 
 
541 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 
529 aa  375  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.26 
 
 
546 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.34 
 
 
602 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.87 
 
 
562 aa  375  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.79 
 
 
541 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.4 
 
 
599 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.26 
 
 
546 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.9 
 
 
634 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  46.45 
 
 
637 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.61 
 
 
574 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.21 
 
 
605 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.9 
 
 
533 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  46.88 
 
 
590 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.85 
 
 
623 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.41 
 
 
610 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  44.24 
 
 
561 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.41 
 
 
611 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.52 
 
 
607 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.12 
 
 
589 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.54 
 
 
640 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.33 
 
 
640 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.1 
 
 
602 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  45.63 
 
 
583 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  43.66 
 
 
640 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  46.3 
 
 
574 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.33 
 
 
640 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.8 
 
 
610 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.33 
 
 
640 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.83 
 
 
528 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.83 
 
 
528 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.31 
 
 
594 aa  364  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.11 
 
 
640 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.49 
 
 
581 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.83 
 
 
579 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.19 
 
 
589 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.49 
 
 
511 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.3 
 
 
527 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.32 
 
 
562 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.23 
 
 
557 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.23 
 
 
557 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.23 
 
 
557 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.23 
 
 
657 aa  360  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.8 
 
 
677 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.07 
 
 
467 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.51 
 
 
405 aa  359  6e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.24 
 
 
617 aa  359  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.05 
 
 
538 aa  359  8e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  42.24 
 
 
617 aa  359  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  44.34 
 
 
581 aa  359  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.34 
 
 
527 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  41.54 
 
 
579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2611  DEAD/DEAH box helicase-like  44.42 
 
 
500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000048378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.8 
 
 
646 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.43 
 
 
525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.43 
 
 
528 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  42.43 
 
 
528 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  42.43 
 
 
525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.43 
 
 
528 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  42.43 
 
 
528 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.49 
 
 
664 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  42.43 
 
 
533 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  42.43 
 
 
528 aa  356  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.73 
 
 
466 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  42.43 
 
 
529 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.43 
 
 
538 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.49 
 
 
664 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.49 
 
 
664 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.06 
 
 
530 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  42.82 
 
 
530 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.96 
 
 
482 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.7 
 
 
595 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.37 
 
 
608 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  45.26 
 
 
563 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  45.88 
 
 
609 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.88 
 
 
609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 
597 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>