More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4969 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
584 aa  1160    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.06 
 
 
550 aa  585  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.51 
 
 
530 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.57 
 
 
539 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.28 
 
 
532 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.2 
 
 
541 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.71 
 
 
533 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.6 
 
 
646 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.44 
 
 
590 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  46.52 
 
 
572 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  45.88 
 
 
656 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.21 
 
 
634 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.74 
 
 
531 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.63 
 
 
561 aa  495  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.19 
 
 
606 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.96 
 
 
640 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  45.75 
 
 
589 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.33 
 
 
527 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.06 
 
 
643 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.13 
 
 
640 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.96 
 
 
640 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.96 
 
 
640 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.77 
 
 
570 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.96 
 
 
640 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.05 
 
 
594 aa  487  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.5 
 
 
611 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  48.79 
 
 
561 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.05 
 
 
562 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.95 
 
 
599 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.53 
 
 
590 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.8 
 
 
610 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.76 
 
 
574 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.06 
 
 
467 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.06 
 
 
595 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.45 
 
 
605 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.28 
 
 
466 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  46.01 
 
 
637 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  45.94 
 
 
614 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  44.39 
 
 
574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.66 
 
 
602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.94 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.19 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  44.17 
 
 
609 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  45.01 
 
 
595 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.3 
 
 
532 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.17 
 
 
609 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.14 
 
 
538 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.82 
 
 
565 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.03 
 
 
599 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.69 
 
 
525 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.69 
 
 
528 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  51.69 
 
 
528 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  51.69 
 
 
528 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  51.69 
 
 
533 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.69 
 
 
528 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.25 
 
 
527 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  51.69 
 
 
529 aa  465  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  51.69 
 
 
525 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  51.69 
 
 
528 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.48 
 
 
482 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.8 
 
 
617 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.24 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  43.76 
 
 
640 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.58 
 
 
622 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.58 
 
 
622 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.7 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.76 
 
 
619 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  45.8 
 
 
617 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.05 
 
 
546 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.39 
 
 
610 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.43 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.65 
 
 
530 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  44.68 
 
 
590 aa  450  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.15 
 
 
607 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  43.72 
 
 
530 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  43.49 
 
 
583 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.8 
 
 
527 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  42.63 
 
 
579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.1 
 
 
528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.1 
 
 
528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.31 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.02 
 
 
529 aa  443  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.44 
 
 
562 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.24 
 
 
591 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.77 
 
 
677 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.94 
 
 
664 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.88 
 
 
538 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.5 
 
 
557 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.5 
 
 
557 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.5 
 
 
557 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.94 
 
 
664 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  44.27 
 
 
581 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.94 
 
 
664 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.39 
 
 
608 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  43.43 
 
 
636 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.74 
 
 
731 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.95 
 
 
594 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.86 
 
 
589 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  41.86 
 
 
589 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.96 
 
 
623 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>