More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3818 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
527 aa  1074    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.34 
 
 
550 aa  668    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.05 
 
 
527 aa  652    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.92 
 
 
565 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  54.94 
 
 
572 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.41 
 
 
531 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  53.65 
 
 
656 aa  600  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.94 
 
 
532 aa  587  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.61 
 
 
527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.33 
 
 
530 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.23 
 
 
590 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.47 
 
 
532 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.96 
 
 
541 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.53 
 
 
539 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.72 
 
 
532 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  45.33 
 
 
580 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.25 
 
 
533 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.19 
 
 
584 aa  492  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.04 
 
 
595 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.9 
 
 
643 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  47.95 
 
 
531 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.96 
 
 
550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  43.9 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.73 
 
 
590 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.5 
 
 
528 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.5 
 
 
528 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.89 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.76 
 
 
570 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.46 
 
 
562 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.65 
 
 
511 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.1 
 
 
536 aa  438  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.83 
 
 
467 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.65 
 
 
525 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.65 
 
 
528 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  49.65 
 
 
528 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49.65 
 
 
528 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  49.65 
 
 
528 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  40.87 
 
 
574 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.65 
 
 
528 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49.65 
 
 
525 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  49.65 
 
 
533 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.09 
 
 
594 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  49.65 
 
 
529 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.41 
 
 
474 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.73 
 
 
546 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  40.48 
 
 
589 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.07 
 
 
562 aa  432  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.18 
 
 
538 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.54 
 
 
546 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.28 
 
 
561 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  42.19 
 
 
590 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.41 
 
 
541 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.67 
 
 
610 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.25 
 
 
599 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.07 
 
 
574 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.96 
 
 
617 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.96 
 
 
617 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  42.24 
 
 
530 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.72 
 
 
482 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.49 
 
 
602 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.04 
 
 
579 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.82 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.89 
 
 
606 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.11 
 
 
610 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.55 
 
 
529 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.08 
 
 
589 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.07 
 
 
605 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 
607 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.7 
 
 
646 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.78 
 
 
637 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.15 
 
 
611 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.27 
 
 
538 aa  410  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.01 
 
 
640 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.01 
 
 
640 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.18 
 
 
640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  37.81 
 
 
579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.01 
 
 
640 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.5 
 
 
622 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.5 
 
 
622 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.45 
 
 
634 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.71 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.01 
 
 
640 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  38.65 
 
 
581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.94 
 
 
594 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.07 
 
 
623 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  42.31 
 
 
579 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.21 
 
 
599 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  37.83 
 
 
614 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  38.96 
 
 
669 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.64 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.18 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  48.82 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.48 
 
 
747 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.19 
 
 
591 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.59 
 
 
557 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  39.92 
 
 
583 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.18 
 
 
595 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.59 
 
 
557 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.74 
 
 
589 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.59 
 
 
557 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>