More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0569 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0569  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 
435 aa  886    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0487433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.42 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0526  superfamily II DNA/RNA helicase  35.29 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1497  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.28 
 
 
405 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.333515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
468 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 
389 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1768  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.77 
 
 
405 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.88 
 
 
439 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0826184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3195  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  33.43 
 
 
389 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1916  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.82 
 
 
389 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1418  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.08 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.69 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.164843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0943  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.18 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2189  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.82 
 
 
389 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000387501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1961  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.82 
 
 
389 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1940  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.82 
 
 
389 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.218077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2143  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.82 
 
 
389 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2119  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.82 
 
 
389 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00322854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.82 
 
 
389 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.82 
 
 
389 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000776254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.74 
 
 
389 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000478043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1460  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.65 
 
 
442 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.65 
 
 
539 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1239  superfamily II DNA/RNA helicase  31.16 
 
 
360 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.604047  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1015  DEAD/DEAH box helicase-like  32.51 
 
 
393 aa  187  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0383  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.48 
 
 
464 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2025  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.59 
 
 
400 aa  186  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222317 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.23 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 
504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0838  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  31.88 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794098  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  31.12 
 
 
530 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004056  ATP-dependent RNA helicase  32.15 
 
 
402 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.668799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  28.09 
 
 
460 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.89 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 
514 aa  183  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 
599 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.06 
 
 
507 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0891  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.93 
 
 
473 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.99 
 
 
546 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.08 
 
 
426 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01406  hypothetical protein  29.47 
 
 
411 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2052  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 
467 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.15758  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.53 
 
 
403 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1989  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.15 
 
 
467 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.5 
 
 
546 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
471 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.5 
 
 
541 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2335  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.86 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0940399  normal  0.127544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.11 
 
 
731 aa  180  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1006  ATP-dependent RNA helicase  33.14 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.456237  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.17 
 
 
471 aa  179  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2168  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.03 
 
 
487 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177474  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.03 
 
 
487 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337747  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  31.2 
 
 
424 aa  179  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.85 
 
 
529 aa  179  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.67 
 
 
584 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.28 
 
 
515 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.28 
 
 
515 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.36 
 
 
549 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0825  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.71 
 
 
360 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.760801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.89 
 
 
535 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2004  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.56 
 
 
467 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0563026  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2189  putative ATP-dependent RNA helicase  32.44 
 
 
398 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0610  DEAD/DEAH box helicase-like  31.09 
 
 
432 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.93 
 
 
611 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.63 
 
 
622 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.23 
 
 
634 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.05 
 
 
491 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338708  normal  0.0711537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
640 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  30.63 
 
 
623 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.79 
 
 
451 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
640 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0124  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.34 
 
 
437 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
640 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.33 
 
 
640 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.17 
 
 
443 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.98 
 
 
479 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
640 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
623 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.63 
 
 
622 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.42 
 
 
619 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.33 
 
 
522 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  30.4 
 
 
574 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  30.03 
 
 
637 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.25 
 
 
530 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  30.9 
 
 
427 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.13 
 
 
415 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.66 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.23 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.52 
 
 
482 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.24 
 
 
605 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  32.31 
 
 
513 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.94 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0132236  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  30.81 
 
 
445 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.03 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.97 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.44 
 
 
607 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
610 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.9 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0112372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0808  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>