More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2189 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2335  DEAD/DEAH box helicase domain protein  78.72 
 
 		 467 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0940399  normal  0.127544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2189  putative ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 		 398 aa  810    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2052  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  78.46 
 
 		 467 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.15758  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2004  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  78.72 
 
 		 467 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0563026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1989  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  79.23 
 
 		 467 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1769  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.63 
 
 		 467 aa  631  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.57 
 
 		 468 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.28 
 
 		 439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0826184  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.82 
 
 		 487 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337747  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2168  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.56 
 
 		 487 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.31 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338708  normal  0.0711537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2571  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  71.79 
 
 		 475 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0891  DEAD/DEAH box helicase-like protein  73.8 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.83 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.914149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0838  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  72.04 
 
 		 403 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794098  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2205  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.26 
 
 		 449 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1418  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  70.41 
 
 		 401 aa  571  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1018  ATP-dependent RNA helicase RhlE  69.37 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1884  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.94 
 
 		 488 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.972108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01406  hypothetical protein  67.25 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0383  ATP-dependent RNA helicase RhlE  67.51 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004056  ATP-dependent RNA helicase  66.92 
 
 		 402 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.668799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1509  DNA topoisomerase III  68.18 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.569341  hitchhiker  0.00000206936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.41 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1015  DEAD/DEAH box helicase-like  65.74 
 
 		 393 aa  537  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  57.07 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  55.25 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  55.53 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.78 
 
 		 550 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.21 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.04 
 
 		 578 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.92 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.7 
 
 		 549 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.87 
 
 		 522 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.64 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.73 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.73 
 
 		 525 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.05 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  54.62 
 
 		 435 aa  431  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.73 
 
 		 525 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.52 
 
 		 549 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.73 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.15 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  55.13 
 
 		 527 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.36 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.9 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.62 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.49 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.65 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  54.64 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.58 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.79 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.71 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  53.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.93 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0304  hypothetical protein  56.27 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.66 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  53.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.69 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.23 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  56 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.4 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  53.23 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.88 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.52 
 
 		 496 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.69 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.27 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.4 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.4 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.4 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.76 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.66 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  54.21 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.4 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.26 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  52.76 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.76 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.26 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.26 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.4 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.76 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  51.76 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.38 
 
 		 515 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.76 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.76 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  51.38 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.76 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.76 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12760  ATP-dependent RNA helicase  50.79 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00382469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.93 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  52.79 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.62 
 
 		 522 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.28 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.28 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.37 
 
 		 488 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>