More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1225 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2640  DEAD/DEAH box helicase domain protein  98.96 
 
 
651 aa  971    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1225  DEAD/DEAH box helicase  100 
 
 
628 aa  1272    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.75882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2544  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  84.58 
 
 
680 aa  852    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.711022  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2734  DEAD/DEAH box helicase domain protein  98.96 
 
 
652 aa  970    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.2 
 
 
908 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.7 
 
 
505 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.09 
 
 
533 aa  327  6e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.38 
 
 
590 aa  326  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  39.62 
 
 
579 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1726  RNA helicase DeaD  38.57 
 
 
611 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.78 
 
 
530 aa  323  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.98 
 
 
546 aa  323  7e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.98 
 
 
546 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.19 
 
 
541 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 
599 aa  318  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.67 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.49 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  40 
 
 
656 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 
634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.28 
 
 
643 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.76 
 
 
584 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
640 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.59 
 
 
539 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.04 
 
 
640 aa  313  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.04 
 
 
640 aa  313  9e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.04 
 
 
640 aa  313  9e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.09 
 
 
640 aa  312  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.07 
 
 
611 aa  312  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
511 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.34 
 
 
538 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.3 
 
 
610 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  41.13 
 
 
644 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000079582  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.5 
 
 
617 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.5 
 
 
617 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.98 
 
 
497 aa  309  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.19 
 
 
538 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.63 
 
 
527 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  38.86 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0341  DEAD/DEAH box helicase-like  40.5 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0103074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  38.68 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.63 
 
 
525 aa  308  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  38.63 
 
 
525 aa  308  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.93 
 
 
564 aa  308  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.72 
 
 
597 aa  307  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.18 
 
 
528 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.18 
 
 
528 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.81 
 
 
467 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3352  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.9 
 
 
741 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.77 
 
 
589 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  38.63 
 
 
533 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.63 
 
 
528 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  38.63 
 
 
528 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  38.63 
 
 
528 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2611  DEAD/DEAH box helicase-like  39.81 
 
 
500 aa  306  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000048378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.63 
 
 
528 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.01 
 
 
527 aa  306  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  38.63 
 
 
528 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.85 
 
 
550 aa  306  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.58 
 
 
663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.87 
 
 
623 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.27 
 
 
632 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.12 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.83 
 
 
622 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.27 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.83 
 
 
622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
529 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  38.57 
 
 
572 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  38.26 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.61 
 
 
619 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.37 
 
 
594 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.37 
 
 
605 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.92 
 
 
530 aa  303  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
623 aa  303  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  39.02 
 
 
579 aa  303  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.71 
 
 
602 aa  302  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.46 
 
 
562 aa  302  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.82 
 
 
590 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.23 
 
 
405 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.2 
 
 
559 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.87 
 
 
531 aa  301  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08811  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  37.9 
 
 
623 aa  301  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  37.15 
 
 
551 aa  301  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 
482 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.02 
 
 
595 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.67 
 
 
532 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  39.47 
 
 
570 aa  300  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.32 
 
 
550 aa  300  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  38.26 
 
 
513 aa  300  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.05 
 
 
561 aa  299  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.53 
 
 
574 aa  299  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.2 
 
 
599 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.97 
 
 
579 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.05 
 
 
513 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.64 
 
 
532 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.51 
 
 
527 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.14 
 
 
990 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.37 
 
 
589 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.64 
 
 
498 aa  297  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  37.98 
 
 
655 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  41.88 
 
 
590 aa  297  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>