More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8451 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.12 
 
 
861 aa  722    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.17 
 
 
775 aa  745    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  60.29 
 
 
761 aa  849    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  52.5 
 
 
833 aa  770    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.52 
 
 
764 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.36 
 
 
790 aa  717    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  50.87 
 
 
771 aa  678    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.7 
 
 
807 aa  829    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.32 
 
 
815 aa  929    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  60.46 
 
 
804 aa  843    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.3 
 
 
815 aa  852    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.25 
 
 
781 aa  726    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
806 aa  1622    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.93 
 
 
824 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.04 
 
 
775 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.14 
 
 
763 aa  797    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  53.5 
 
 
795 aa  781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.03 
 
 
804 aa  857    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.02 
 
 
868 aa  732    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  56.23 
 
 
798 aa  804    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.37 
 
 
807 aa  899    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  53.16 
 
 
865 aa  743    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60 
 
 
778 aa  928    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.45 
 
 
812 aa  779    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  51.76 
 
 
780 aa  691    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.04 
 
 
775 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.31 
 
 
782 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  49.83 
 
 
891 aa  777    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.6 
 
 
803 aa  719    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.7 
 
 
802 aa  816    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.78 
 
 
775 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.83 
 
 
848 aa  781    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  55.63 
 
 
795 aa  850    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.61 
 
 
764 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  58.48 
 
 
866 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.08 
 
 
764 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.77 
 
 
868 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  44.11 
 
 
862 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.13 
 
 
902 aa  561  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.29 
 
 
764 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.86 
 
 
764 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  40.16 
 
 
986 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.79 
 
 
1053 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.62 
 
 
773 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.99 
 
 
762 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  41.19 
 
 
761 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.7 
 
 
739 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.71 
 
 
807 aa  480  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.86 
 
 
973 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.29 
 
 
962 aa  478  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 
959 aa  475  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.51 
 
 
758 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.48 
 
 
751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.03 
 
 
752 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  37.2 
 
 
751 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.14 
 
 
768 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  40.47 
 
 
797 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  35.66 
 
 
912 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.56 
 
 
753 aa  458  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.63 
 
 
790 aa  459  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.97 
 
 
972 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.01 
 
 
1198 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.87 
 
 
941 aa  443  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 
789 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  37.18 
 
 
738 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.88 
 
 
1086 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.4 
 
 
808 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  35.5 
 
 
831 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.51 
 
 
829 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.02 
 
 
805 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.62 
 
 
759 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  35.03 
 
 
815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.84 
 
 
838 aa  399  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.09 
 
 
896 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.37 
 
 
685 aa  354  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.98 
 
 
855 aa  353  5e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  31.29 
 
 
1210 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  32.49 
 
 
758 aa  332  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 
897 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.54 
 
 
803 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  28.86 
 
 
1178 aa  296  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  32.49 
 
 
948 aa  293  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
744 aa  290  9e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  30.98 
 
 
931 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.36 
 
 
756 aa  280  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.89 
 
 
744 aa  273  7e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.48 
 
 
751 aa  273  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
744 aa  272  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 
744 aa  266  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.4 
 
 
739 aa  248  4.9999999999999997e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
740 aa  247  6e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.18 
 
 
815 aa  235  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.81 
 
 
766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  24.32 
 
 
905 aa  208  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.79 
 
 
914 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.74 
 
 
911 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26 
 
 
876 aa  175  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 
879 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  33.54 
 
 
1321 aa  145  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  25.44 
 
 
906 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>