More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1480 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
403 aa  821    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.8 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  53.81 
 
 
432 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  57.07 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.1 
 
 
451 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.53 
 
 
447 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.5 
 
 
467 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.06 
 
 
450 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.94 
 
 
425 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0754  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.2 
 
 
447 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.33 
 
 
453 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.33 
 
 
471 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1998  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.35 
 
 
444 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0183  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.66 
 
 
560 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.475928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_172  hypothetical protein  48.92 
 
 
561 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000114775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.77 
 
 
462 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 
561 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.77 
 
 
511 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.86 
 
 
494 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.94 
 
 
513 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.1 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.48 
 
 
506 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.45 
 
 
522 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  47.45 
 
 
527 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.68 
 
 
426 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.56 
 
 
496 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.21 
 
 
463 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.59 
 
 
443 aa  354  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 
525 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.96 
 
 
515 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.96 
 
 
526 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.96 
 
 
525 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.98 
 
 
477 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.19 
 
 
452 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.07 
 
 
560 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  46.07 
 
 
540 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.89 
 
 
522 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  46.4 
 
 
429 aa  346  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  46.81 
 
 
445 aa  346  5e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0838  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  45.34 
 
 
403 aa  345  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794098  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.81 
 
 
565 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.91 
 
 
411 aa  344  1e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  46.67 
 
 
435 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.7 
 
 
549 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  45.91 
 
 
420 aa  344  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  45.38 
 
 
543 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.77 
 
 
578 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.37 
 
 
550 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.36 
 
 
471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.02 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.31 
 
 
540 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.95 
 
 
462 aa  342  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0304  hypothetical protein  46.44 
 
 
414 aa  342  9e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.81 
 
 
485 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.81 
 
 
485 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  46.15 
 
 
414 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  43.81 
 
 
485 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.24 
 
 
482 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.81 
 
 
485 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.81 
 
 
485 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.62 
 
 
535 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.12 
 
 
515 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.97 
 
 
479 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.97 
 
 
480 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  43.94 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.92 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.2 
 
 
425 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.73 
 
 
488 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.97 
 
 
486 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0943  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.48 
 
 
409 aa  339  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0145  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.28 
 
 
446 aa  339  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  44.97 
 
 
486 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.97 
 
 
486 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.21 
 
 
441 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.83 
 
 
514 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.54 
 
 
482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  45.12 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  45.69 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.21 
 
 
479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  45.67 
 
 
495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.09 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45.93 
 
 
537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.77 
 
 
453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.77 
 
 
453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.17 
 
 
476 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.71 
 
 
480 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.77 
 
 
453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.77 
 
 
453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.77 
 
 
453 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  43.61 
 
 
495 aa  336  5e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.15 
 
 
454 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.33 
 
 
451 aa  335  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.55 
 
 
556 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.62 
 
 
493 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0163  ATP-dependent RNA helicase  45.04 
 
 
446 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.15 
 
 
454 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  44.36 
 
 
473 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  43.84 
 
 
516 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.15 
 
 
454 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  46.15 
 
 
454 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>