76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0510 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  99.43 
 
 
701 aa  1448    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  100 
 
 
701 aa  1454    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  49.93 
 
 
726 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  60.93 
 
 
707 aa  842    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  29.11 
 
 
725 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1861  DEAD/DEAH box helicase-like  23.39 
 
 
692 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1557  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.25 
 
 
696 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.476169  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3576  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.08 
 
 
717 aa  82.8  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.33 
 
 
759 aa  68.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.86 
 
 
805 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.39 
 
 
751 aa  61.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.53 
 
 
752 aa  60.8  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.95 
 
 
758 aa  60.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.68 
 
 
764 aa  58.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.51 
 
 
768 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  27.38 
 
 
761 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.85 
 
 
808 aa  57.4  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  24.89 
 
 
484 aa  57  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.81 
 
 
696 aa  54.7  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  23.65 
 
 
738 aa  55.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.84 
 
 
1534 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.93 
 
 
1053 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.16 
 
 
970 aa  53.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  24 
 
 
828 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  25.55 
 
 
797 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  26.42 
 
 
873 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24 
 
 
829 aa  52  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.87 
 
 
778 aa  51.6  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  24 
 
 
986 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  25.42 
 
 
764 aa  51.6  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  25 
 
 
741 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.72 
 
 
739 aa  51.2  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.6 
 
 
962 aa  50.8  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.2 
 
 
764 aa  50.8  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  22.02 
 
 
582 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  23.87 
 
 
831 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  23.82 
 
 
906 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  22.11 
 
 
914 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.55 
 
 
1770 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  29.13 
 
 
729 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.11 
 
 
959 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  20.18 
 
 
843 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.63 
 
 
701 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  22.97 
 
 
780 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.08 
 
 
911 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.34 
 
 
789 aa  47.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 
799 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.63 
 
 
600 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  40.68 
 
 
967 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  22.49 
 
 
1534 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.81 
 
 
488 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.23 
 
 
972 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  22.89 
 
 
806 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 
795 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.63 
 
 
675 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.85 
 
 
828 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  22.54 
 
 
517 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.58 
 
 
803 aa  45.8  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.25 
 
 
711 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.18 
 
 
729 aa  45.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  25.25 
 
 
491 aa  45.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.75 
 
 
824 aa  45.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.92 
 
 
737 aa  45.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  31.82 
 
 
566 aa  45.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.8 
 
 
740 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  21.59 
 
 
828 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  23.18 
 
 
740 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.5 
 
 
775 aa  44.3  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  30.3 
 
 
747 aa  44.3  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  23.81 
 
 
859 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  27.92 
 
 
905 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  31.25 
 
 
1644 aa  43.9  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.82 
 
 
744 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  25.51 
 
 
1210 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.34 
 
 
802 aa  43.9  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  21.72 
 
 
548 aa  43.9  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>