47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1557 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1557  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 696 aa  1424    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.476169  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3576  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  27.79 
 
 		 717 aa  251  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1861  DEAD/DEAH box helicase-like  28.45 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  22.95 
 
 		 725 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  28.61 
 
 		 726 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.18 
 
 		 707 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  24 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.44 
 
 		 701 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  25.93 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2231  helicase superfamily protein  23.88 
 
 		 778 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0331  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 1052 aa  57  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 764 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  32.16 
 
 		 2082 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  30.63 
 
 		 797 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.74 
 
 		 2136 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27 
 
 		 1722 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.58 
 
 		 751 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.56 
 
 		 1723 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.93 
 
 		 805 aa  48.5  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  28.72 
 
 		 905 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  35.37 
 
 		 2106 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  23.28 
 
 		 1534 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.75 
 
 		 739 aa  47.8  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 751 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  29.73 
 
 		 2125 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.67 
 
 		 768 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  23.33 
 
 		 807 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.22 
 
 		 740 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.71 
 
 		 801 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 1602 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.88 
 
 		 815 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  29.79 
 
 		 1578 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.28 
 
 		 851 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.2 
 
 		 752 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  26.35 
 
 		 833 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  26.46 
 
 		 2124 aa  45.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  39.74 
 
 		 2087 aa  45.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.09 
 
 		 744 aa  44.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.86 
 
 		 946 aa  44.3  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 1613 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1323  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.17 
 
 		 701 aa  44.3  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.122817  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.64 
 
 		 744 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.8 
 
 		 1053 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.6 
 
 		 807 aa  44.3  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.39 
 
 		 970 aa  43.9  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.88 
 
 		 759 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.06 
 
 		 1198 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>