17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4165 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 725 aa  1502    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  31.81 
 
 		 707 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  31.86 
 
 		 726 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  28.97 
 
 		 701 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  29.11 
 
 		 701 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3576  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.48 
 
 		 717 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1557  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.39 
 
 		 696 aa  118  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.476169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1861  DEAD/DEAH box helicase-like  26.65 
 
 		 692 aa  97.4  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2231  helicase superfamily protein  23.05 
 
 		 778 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  27.18 
 
 		 2087 aa  47.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  25 
 
 		 1178 aa  47.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.7 
 
 		 759 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  30.63 
 
 		 484 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.71 
 
 		 970 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0331  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 1052 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  20.88 
 
 		 799 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  27.08 
 
 		 1704 aa  44.3  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>